Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RGPD3A6NKT7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD3A6NKT7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RGPD3A6NKT7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RGPD3A6NKT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD3A6NKT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD3A6NKT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD3A6NKT7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RGPD3A6NKT7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD3A6NKT7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD3A6NKT7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD3A6NKT7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD3A6NKT7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RGPD3A6NKT7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD3A6NKT7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD3A6NKT7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD3A6NKT7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms