Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.156e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.716e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.225e-7■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.69e-9■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACBD3-202ENST00000464927 294 ntTSL 23.76□□□□□ -1.819e-9■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 UTRN-206ENST00000421035 572 ntTSL 28.91□□□□□ -0.982e-25■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 UTRN-213ENST00000628146 597 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-25■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 LUC7L3-209ENST00000506686 582 ntTSL 412.27□□□□□ -0.453e-10■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 TUG1-207ENST00000569384 443 ntTSL 26.41□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 TUG1-209ENST00000602971 1599 ntTSL 24.76□□□□□ -1.652e-7■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.782e-7■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 TUG1-203ENST00000540687 2744 ntTSL 1 (best)3.49□□□□□ -1.852e-7■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 TUG1-208ENST00000602393 2233 ntTSL 23.29□□□□□ -1.882e-7■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.117e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.227e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.44□□□□□ -1.547e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-19■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.195e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACAD11-207ENST00000489991 574 ntTSL 412.92□□□□□ -0.345e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACAD11-202ENST00000469042 3276 ntTSL 211.79□□□□□ -0.525e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACAD11-205ENST00000485198 2940 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.535e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 ACAD11-208ENST00000496418 3684 ntTSL 26.9□□□□□ -1.315e-6■□□□□ 9.7
HLTFQ14527 COG5-209ENST00000484237 574 ntTSL 47.11□□□□□ -1.273e-8■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 512.28□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.325e-6■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.595e-6■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.675e-6■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SOS1-205ENST00000461545 441 ntTSL 33.31□□□□□ -1.885e-6■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-201ENST00000311943 2016 ntTSL 211.87□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-206ENST00000484733 2308 ntTSL 511.48□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-215ENST00000555259 1553 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.851e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-222ENST00000556768 1829 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.251e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-214ENST00000554819 608 ntTSL 54.96□□□□□ -1.621e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.651e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SCFD1-204ENST00000463622 1943 ntTSL 23.52□□□□□ -1.851e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 512.39□□□□□ -0.433e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 512.21□□□□□ -0.463e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.53e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-209ENST00000578758 667 ntTSL 210.22□□□□□ -0.773e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-213ENST00000579996 820 ntTSL 29.04□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 29.02□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-208ENST00000578491 463 ntTSL 27.59□□□□□ -1.193e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-212ENST00000579461 814 ntTSL 35.43□□□□□ -1.543e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX5-234ENST00000585317 923 ntTSL 24.09□□□□□ -1.753e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 UBR4-201ENST00000375218 4031 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.831e-10■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.555e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 217.16■□□□□ 0.345e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.165e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.15e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 215.43■□□□□ 0.065e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 317.78■□□□□ 0.441e-7■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.841e-42■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 SETD2-209ENST00000638947 1984 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-13■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX18-204ENST00000474694 1083 ntTSL 58.2□□□□□ -1.13e-8■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.233e-8■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.064e-10■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.084e-10■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 ARID4A-201ENST00000348476 5562 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.834e-10■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.44e-10■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 ARID4A-204ENST00000417477 2537 ntTSL 1 (best)4.85□□□□□ -1.634e-10■□□□□ 9.6
HLTFQ14527 LIMS1-208ENST00000428064 637 ntTSL 221.01■□□□□ 0.951e-8■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 GREB1-209ENST00000472040 571 ntTSL 514.75□□□□□ -0.054e-8■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SF3B1-206ENST00000462613 141 ntTSL 36.32□□□□□ -1.41e-11■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.144e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-8■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 CEP250-204ENST00000422671 2648 ntTSL 515.37■□□□□ 0.055e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.151e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.331e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.321e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.041e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-210ENST00000505941 917 ntTSL 220.87■□□□□ 0.931e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-220ENST00000511663 966 ntTSL 519.27■□□□□ 0.681e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-218ENST00000511185 1071 ntTSL 218.55■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-214ENST00000509677 1087 ntTSL 317.92■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 217.74■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-223ENST00000512131 615 ntTSL 217.04■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-206ENST00000503219 551 ntTSL 416.07■□□□□ 0.161e-7■□□□□ 9.5
HLTFQ14527 SH3BP2-215ENST00000510074 649 ntTSL 515.97■□□□□ 0.151e-7■□□□□ 9.5
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