RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503219.5

SH3BP2-206, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-206ENST00000503219 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.08■■■■■ 4.01
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SH3BP2-206ENST00000503219 BICRAQ9NZM4 1560 aa33■■■□□ 2.87
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SH3BP2-206ENST00000503219 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.31■■■□□ 2.76
SH3BP2-206ENST00000503219 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.11■■■□□ 2.73
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SH3BP2-206ENST00000503219 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.91■■■□□ 2.7
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SH3BP2-206ENST00000503219 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.84■■■□□ 2.53
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SH3BP2-206ENST00000503219 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.36■■■□□ 2.45
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SH3BP2-206ENST00000503219 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.29■■■□□ 2.44
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SH3BP2-206ENST00000503219 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-206ENST00000503219 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-206ENST00000503219 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-206ENST00000503219 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP2-206ENST00000503219 WDR62O43379 1518 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BP2-206ENST00000503219 PRDM2Q13029 1718 aa29.72■■■□□ 2.35
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SH3BP2-206ENST00000503219 ABCC8Q09428 1581 aa29.19■■■□□ 2.26
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SH3BP2-206ENST00000503219 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-206ENST00000503219 SOGA1O94964 1423 aa28.95■■■□□ 2.23
SH3BP2-206ENST00000503219 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
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SH3BP2-206ENST00000503219 CHD1O14646 1710 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-206ENST00000503219 WDR97A6NE52 1622 aa28.8■■■□□ 2.2
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SH3BP2-206ENST00000503219 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-206ENST00000503219 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-206ENST00000503219 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-206ENST00000503219 SYNJ1O43426 1573 aa28.71■■■□□ 2.19
SH3BP2-206ENST00000503219 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP2-206ENST00000503219 PBRM1Q86U86 1689 aa28.65■■■□□ 2.18
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SH3BP2-206ENST00000503219 TOP2BQ02880 1626 aa28.64■■■□□ 2.18
SH3BP2-206ENST00000503219 ARHGEF11O15085 1522 aa28.64■■■□□ 2.17
SH3BP2-206ENST00000503219 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.17
SH3BP2-206ENST00000503219 GRIN2BQ13224 1484 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP2-206ENST00000503219 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP2-206ENST00000503219 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.6■■■□□ 2.17
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SH3BP2-206ENST00000503219 NUP160Q12769 1436 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-206ENST00000503219 SHROOM2Q13796 1616 aa28.05■■■□□ 2.08
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SH3BP2-206ENST00000503219 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SH3BP2-206ENST00000503219 CUL7Q14999 1698 aa27.92■■■□□ 2.06
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