Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ZC3H11A-206ENST00000453771 1892 ntTSL 510.69□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-205ENST00000432282 682 ntTSL 59.29□□□□□ -0.925e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 XYLB-202ENST00000424034 3484 ntTSL 28.91□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.25e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.415e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 55.24□□□□□ -1.575e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.65e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)4.97□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.795e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.93e-8■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.345e-9■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 DLEU1-224ENST00000483444 332 ntTSL 1 (best)4□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 DLEU1-216ENST00000473075 348 ntTSL 53.96□□□□□ -1.783e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 BRD9-210ENST00000493082 750 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.498e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 FAF1-203ENST00000472808 759 ntTSL 35.32□□□□□ -1.566e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.371e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.61e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 F11-AS1-203ENST00000508287 669 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.918e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.778e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 CCSAP-204ENST00000483092 3492 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.978e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.774e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PTDSS2-212ENST00000531520 890 ntTSL 318.78■□□□□ 0.64e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PTDSS2-213ENST00000532614 437 ntTSL 313.2□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 211.47□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.646e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 ADGRV1-236ENST00000640779 4680 ntTSL 56.53□□□□□ -1.369e-9■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 26.38□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 ADGRV1-218ENST00000639473 6608 ntTSL 56.14□□□□□ -1.439e-9■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 54.69□□□□□ -1.662e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 ADGRV1-232ENST00000640403 6723 ntTSL 53.73□□□□□ -1.819e-9■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.345e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.125e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.965e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.935e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.785e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 511.18□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 39.71□□□□□ -0.865e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -15e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 38.49□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 47.87□□□□□ -1.155e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 MFGE8-217ENST00000617199 2464 nt12.09□□□□□ -0.474e-11■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 MFGE8-213ENST00000560553 500 ntTSL 49.19□□□□□ -0.944e-11■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 EEF2K-204ENST00000568269 2367 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -02e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 EEF2K-203ENST00000563555 610 ntTSL 56.28□□□□□ -1.42e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.612e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.295e-8■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 REEP6-202ENST00000395479 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.27■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 REEP6-203ENST00000395484 611 ntTSL 511.71□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.929e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.476e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.036e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.866e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.279e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 FAM13A-204ENST00000502914 587 ntTSL 45.82□□□□□ -1.489e-7■■■■□ 24.4
TARDBPQ13148 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 515.15■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-9■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CTNND1-224ENST00000530068 579 ntTSL 411.56□□□□□ -0.563e-11■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-11■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.744e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-207ENST00000465947 793 ntTSL 517.62■□□□□ 0.414e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-226ENST00000631619 2457 ntTSL 517.05■□□□□ 0.324e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-222ENST00000479596 883 ntTSL 315.12■□□□□ 0.014e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-217ENST00000476367 1603 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.174e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-219ENST00000477127 1464 ntTSL 513.7□□□□□ -0.224e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-212ENST00000470121 1889 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.344e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-216ENST00000475298 2362 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.384e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-209ENST00000467081 564 ntTSL 37.39□□□□□ -1.234e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-220ENST00000478454 580 ntTSL 45.21□□□□□ -1.584e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CCNL1-205ENST00000464575 505 ntTSL 44.7□□□□□ -1.664e-19■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.526e-7■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 57.23□□□□□ -1.257e-7■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 519.41■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24.3
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 369.9 ms