Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ACACA-233ENST00000614450 591 ntTSL 46.36□□□□□ -1.398e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 FTO-201ENST00000268349 2799 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.48e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 TTI1-206ENST00000620381 432 nt5.4□□□□□ -1.548e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.618e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.718e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SEC23IP-206ENST00000475542 552 ntTSL 34.06□□□□□ -1.768e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 TFG-206ENST00000481203 3271 ntTSL 24.04□□□□□ -1.768e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PA2G4-202ENST00000550166 520 ntTSL 33.8□□□□□ -1.88e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 ESD-205ENST00000495654 701 ntTSL 53.39□□□□□ -1.878e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.878e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 ESD-204ENST00000471867 2410 ntTSL 23.33□□□□□ -1.888e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 IDH1-204ENST00000417583 702 ntTSL 417.56■□□□□ 0.46e-13■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.683e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 224.42■■□□□ 1.53e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 MTHFD1-214ENST00000556771 813 ntTSL 213.08□□□□□ -0.323e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 IDH3B-203ENST00000462967 959 ntTSL 219.51■□□□□ 0.712e-9■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 TRAP1-217ENST00000576788 568 ntTSL 412.1□□□□□ -0.473e-12■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.67e-8■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.367e-8■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.097e-8■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.047e-8■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SEC23A-211ENST00000555682 398 ntTSL 24.02□□□□□ -1.774e-15■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.498e-13■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 312.85□□□□□ -0.353e-27■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 ATP5O-203ENST00000418933 415 ntTSL 56.72□□□□□ -1.332e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.721e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.261e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 PPP2R1A-208ENST00000473820 646 ntTSL 212.24□□□□□ -0.454e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL2-202ENST00000540127 439 ntTSL 35.64□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 STIP1-212ENST00000544739 562 ntTSL 35.01□□□□□ -1.612e-8■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.079e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.119e-7■■□□□ 13.3
G3BP1Q13283 KRT18-203ENST00000546656 521 ntTSL 217.3■□□□□ 0.363e-11■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 TPI1-203ENST00000462761 374 ntTSL 313.5□□□□□ -0.255e-9■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 QARS-249ENST00000637113 1369 ntTSL 519.91■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 QARS-250ENST00000637281 1327 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.344e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 218.73■□□□□ 0.593e-10■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MACF1-202ENST00000360115 2824 ntTSL 515.74■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 215.57■□□□□ 0.081e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 525.8■■□□□ 1.725e-8■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.662e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GRB2-209ENST00000581959 359 ntTSL 34.22□□□□□ -1.732e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 516.72■□□□□ 0.279e-14■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.277e-11■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 NOP2-204ENST00000400580 561 ntTSL 314.53□□□□□ -0.082e-8■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.28e-13■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.628e-13■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.388e-8■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.388e-8■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MCM4-209ENST00000520637 839 ntTSL 213.09□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 PEG10-201ENST00000465184 788 ntTSL 36.48□□□□□ -1.374e-19■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 516.7■□□□□ 0.266e-8■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 YWHAQ-203ENST00000446619 665 ntTSL 325.94■■□□□ 1.743e-11■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-12■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.393e-12■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-12■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)6.72□□□□□ -1.333e-12■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 TNRC18-207ENST00000440081 757 ntTSL 313.66□□□□□ -0.227e-8■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 PRRC2B-205ENST00000451855 1762 ntTSL 526.71■■□□□ 1.873e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.639e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.999e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.349e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.379e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.499e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 UGP2-211ENST00000475550 4397 ntTSL 1 (best)5.52□□□□□ -1.539e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.021e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-204ENST00000464758 752 ntTSL 327.2■■□□□ 1.941e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-216ENST00000585475 580 ntTSL 526.11■■□□□ 1.771e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-213ENST00000493104 1116 ntTSL 223.79■■□□□ 1.41e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-203ENST00000461602 880 ntTSL 323.04■■□□□ 1.281e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-214ENST00000493383 727 ntTSL 221.79■■□□□ 1.081e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-206ENST00000474548 529 ntTSL 221.25■□□□□ 0.991e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-209ENST00000477736 843 ntTSL 220.97■□□□□ 0.951e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 AC087289.3-201ENST00000590947 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.82■□□□□ 0.921e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 MRPL38-215ENST00000494179 870 ntTSL 320.65■□□□□ 0.91e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 HIF1A-205ENST00000547430 711 ntTSL 27.9□□□□□ -1.143e-9■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-220ENST00000639667 3940 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-9■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 ATIC-204ENST00000427397 1046 ntTSL 523.22■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 USP7-205ENST00000562615 304 ntTSL 25.04□□□□□ -1.68e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 LMNA-218ENST00000502357 537 ntTSL 415.53■□□□□ 0.083e-10■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 CPPED1-204ENST00000539677 568 ntTSL 216.63■□□□□ 0.253e-10■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 NDUFS1-210ENST00000498520 593 ntTSL 27.81□□□□□ -1.166e-7■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 USP7-207ENST00000563085 3194 ntTSL 27.72□□□□□ -1.171e-6■■□□□ 13.2
G3BP1Q13283 USP7-211ENST00000565883 453 ntTSL 24.94□□□□□ -1.621e-6■■□□□ 13.2
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 112 ms