Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYO1EQ12965 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYO1EQ12965 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms