Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
MYO1EQ12965 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MYO1EQ12965 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MYO1EQ12965 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
MYO1EQ12965 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MYO1EQ12965 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MYO1EQ12965 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MYO1EQ12965 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYO1EQ12965 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYO1EQ12965 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
MYO1EQ12965 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MYO1EQ12965 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MYO1EQ12965 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO1EQ12965 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYO1EQ12965 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MYO1EQ12965 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MYO1EQ12965 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MYO1EQ12965 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYO1EQ12965 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYO1EQ12965 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYO1EQ12965 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYO1EQ12965 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MYO1EQ12965 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYO1EQ12965 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYO1EQ12965 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYO1EQ12965 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MYO1EQ12965 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MYO1EQ12965 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MYO1EQ12965 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MYO1EQ12965 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYO1EQ12965 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYO1EQ12965 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYO1EQ12965 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MYO1EQ12965 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MYO1EQ12965 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MYO1EQ12965 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MYO1EQ12965 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MYO1EQ12965 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MYO1EQ12965 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MYO1EQ12965 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MYO1EQ12965 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MYO1EQ12965 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MYO1EQ12965 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MYO1EQ12965 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
MYO1EQ12965 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MYO1EQ12965 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MYO1EQ12965 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MYO1EQ12965 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MYO1EQ12965 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MYO1EQ12965 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
MYO1EQ12965 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MYO1EQ12965 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MYO1EQ12965 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MYO1EQ12965 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MYO1EQ12965 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MYO1EQ12965 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MYO1EQ12965 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYO1EQ12965 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYO1EQ12965 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYO1EQ12965 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYO1EQ12965 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MYO1EQ12965 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MYO1EQ12965 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MYO1EQ12965 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MYO1EQ12965 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
MYO1EQ12965 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MYO1EQ12965 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MYO1EQ12965 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MYO1EQ12965 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYO1EQ12965 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYO1EQ12965 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYO1EQ12965 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYO1EQ12965 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MYO1EQ12965 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYO1EQ12965 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYO1EQ12965 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYO1EQ12965 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYO1EQ12965 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYO1EQ12965 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYO1EQ12965 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MYO1EQ12965 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MYO1EQ12965 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MYO1EQ12965 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MYO1EQ12965 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MYO1EQ12965 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MYO1EQ12965 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MYO1EQ12965 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MYO1EQ12965 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MYO1EQ12965 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYO1EQ12965 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MYO1EQ12965 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MYO1EQ12965 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYO1EQ12965 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYO1EQ12965 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYO1EQ12965 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYO1EQ12965 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYO1EQ12965 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYO1EQ12965 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
MYO1EQ12965 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYO1EQ12965 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms