Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CUL1Q13616 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CUL1Q13616 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL1Q13616 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CUL1Q13616 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL1Q13616 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL1Q13616 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
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