Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PUM1Q14671 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.125e-12■■□□□ 12.1
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PUM1Q14671 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-9■■□□□ 12
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PUM1Q14671 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.191e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 PRKCSH-215ENST00000592435 358 ntTSL 510.2□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.194e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.564e-7■■□□□ 12
PUM1Q14671 SSRP1-205ENST00000635721 675 ntTSL 57.2□□□□□ -1.261e-7■■□□□ 12
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PUM1Q14671 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-9■■□□□ 12
PUM1Q14671 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-9■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-6■■□□□ 12
PUM1Q14671 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 214.94□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 12
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PUM1Q14671 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-7■■□□□ 12
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PUM1Q14671 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.051e-10■■□□□ 12
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