Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTIFO43310 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTIFO43310 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTIFO43310 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTIFO43310 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTIFO43310 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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