Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.25□□□□□ -1.412e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 EXOC3L4-207ENST00000560925 2341 ntTSL 222.52■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-216ENST00000542532 641 ntTSL 225.84■■□□□ 1.738e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-217ENST00000542692 588 ntTSL 324.99■■□□□ 1.598e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.018e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-211ENST00000539872 594 ntTSL 310.78□□□□□ -0.688e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-215ENST00000541878 578 ntTSL 46.29□□□□□ -1.48e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-218ENST00000542902 613 ntTSL 36.21□□□□□ -1.428e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-214ENST00000541786 590 ntTSL 45.86□□□□□ -1.478e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-213ENST00000541186 881 ntTSL 55.69□□□□□ -1.58e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.758e-7■■■■□ 25.3
TARDBPQ13148 EXOC6-202ENST00000371543 2714 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-8■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-8■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.181e-8■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.871e-8■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.216e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RUNX1-213ENST00000469087 1790 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-29■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 MDM4-208ENST00000462012 582 ntTSL 212.43□□□□□ -0.421e-10■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 MDM4-201ENST00000367179 697 ntTSL 35.06□□□□□ -1.61e-10■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NRDC-205ENST00000468722 754 ntTSL 316.3■□□□□ 0.25e-13■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 225.64■■□□□ 1.78e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 224.06■■□□□ 1.448e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 322.07■■□□□ 1.128e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 320.58■□□□□ 0.898e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.871e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 520.3■□□□□ 0.848e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.798e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-211ENST00000559742 2584 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.471e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.388e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-204ENST00000478717 2722 ntTSL 1 (best)17.34■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-210ENST00000559086 538 ntTSL 417.34■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-216ENST00000449311 681 ntTSL 517.27■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 216.46■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-205ENST00000485596 2999 ntTSL 1 (best)16.38■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-202ENST00000409106 3120 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-201ENST00000460601 2137 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.091e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RIPOR3-203ENST00000462493 2698 ntTSL 215.22■□□□□ 0.031e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 514.56□□□□□ -0.081e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 AC003006.1-201ENST00000599221 421 ntTSL 314.28□□□□□ -0.121e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 314.1□□□□□ -0.151e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-208ENST00000595758 606 ntTSL 414.01□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-204ENST00000474543 2047 ntTSL 513.64□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-205ENST00000477741 2070 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-212ENST00000596549 580 ntTSL 413.13□□□□□ -0.311e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 512.59□□□□□ -0.391e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-217ENST00000599165 570 ntTSL 412.17□□□□□ -0.461e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.461e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.478e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 411.47□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-204ENST00000372798 1563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-208ENST00000431651 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.03□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 GPR21-201ENST00000373642 1170 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.661e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 DHX35-202ENST00000373323 2347 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.691e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RABGAP1-213ENST00000616002 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-209ENST00000596104 531 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-213ENST00000451651 585 ntTSL 310.32□□□□□ -0.761e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-202ENST00000372792 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 59.92□□□□□ -0.821e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 59.9□□□□□ -0.821e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-205ENST00000415798 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.82□□□□□ -0.841e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 38.46□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-206ENST00000478389 3581 ntTSL 28.36□□□□□ -1.071e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 DHX35-206ENST00000484417 3318 ntTSL 28.25□□□□□ -1.091e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-209ENST00000469702 784 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-219ENST00000490251 2135 ntTSL 28.07□□□□□ -1.121e-7■■■■□ 25.2
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 350.9 ms