RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462012.1

MDM4-208, Transcript of MDM4, p53 regulator, humanhuman

TSL 2

Gene MDM4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM4-208ENST00000462012 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.65■■■□□ 2.5
MDM4-208ENST00000462012 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.24■■□□□ 1.95
MDM4-208ENST00000462012 ABCC9O60706 1549 aa26.45■■□□□ 1.83
MDM4-208ENST00000462012 NACADO15069 1562 aa25.63■■□□□ 1.69
MDM4-208ENST00000462012 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.61■■□□□ 1.69
MDM4-208ENST00000462012 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.6■■□□□ 1.69
MDM4-208ENST00000462012 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
MDM4-208ENST00000462012 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.47■■□□□ 1.67
MDM4-208ENST00000462012 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.46■■□□□ 1.67
MDM4-208ENST00000462012 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.87■■□□□ 1.57
MDM4-208ENST00000462012 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.76■■□□□ 1.55
MDM4-208ENST00000462012 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
MDM4-208ENST00000462012 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.71■■□□□ 1.55
MDM4-208ENST00000462012 SCRIBQ14160 1630 aa24.71■■□□□ 1.55
MDM4-208ENST00000462012 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.21■■□□□ 1.47
MDM4-208ENST00000462012 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
MDM4-208ENST00000462012 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.97■■□□□ 1.43
MDM4-208ENST00000462012 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.83■■□□□ 1.41
MDM4-208ENST00000462012 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
MDM4-208ENST00000462012 SMARCA4P51532 1647 aa23.73■■□□□ 1.39
MDM4-208ENST00000462012 NCAPD3P42695 1498 aa23.67■■□□□ 1.38
MDM4-208ENST00000462012 SMARCA2P51531 1590 aa23.64■■□□□ 1.37
MDM4-208ENST00000462012 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
MDM4-208ENST00000462012 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
MDM4-208ENST00000462012 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.56■■□□□ 1.36
MDM4-208ENST00000462012 HMGXB3Q12766 1538 aa23.53■■□□□ 1.36
MDM4-208ENST00000462012 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
MDM4-208ENST00000462012 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
MDM4-208ENST00000462012 WIZO95785 1651 aa23.25■■□□□ 1.31
MDM4-208ENST00000462012 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
MDM4-208ENST00000462012 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23■■□□□ 1.27
MDM4-208ENST00000462012 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.95■■□□□ 1.26
MDM4-208ENST00000462012 NESP48681 1621 aa22.9■■□□□ 1.26
MDM4-208ENST00000462012 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.87■■□□□ 1.25
MDM4-208ENST00000462012 ERCC6Q03468 1493 aa22.85■■□□□ 1.25
MDM4-208ENST00000462012 CFTRP13569 1480 aa22.83■■□□□ 1.25
MDM4-208ENST00000462012 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.82■■□□□ 1.24
MDM4-208ENST00000462012 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MDM4-208ENST00000462012 CUX2O14529 1486 aa22.67■■□□□ 1.22
MDM4-208ENST00000462012 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.64■■□□□ 1.21
MDM4-208ENST00000462012 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.62■■□□□ 1.21
MDM4-208ENST00000462012 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.61■■□□□ 1.21
MDM4-208ENST00000462012 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
MDM4-208ENST00000462012 PRDM2Q13029 1718 aa22.57■■□□□ 1.2
MDM4-208ENST00000462012 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.57■■□□□ 1.2
MDM4-208ENST00000462012 WDR62O43379 1518 aa22.49■■□□□ 1.19
MDM4-208ENST00000462012 ABCC8Q09428 1581 aa22.41■■□□□ 1.18
MDM4-208ENST00000462012 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
MDM4-208ENST00000462012 TOPBP1Q92547 1522 aa22.27■■□□□ 1.16
MDM4-208ENST00000462012 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.27■■□□□ 1.16
MDM4-208ENST00000462012 IFT140Q96RY7 1462 aa22.17■■□□□ 1.14
MDM4-208ENST00000462012 CUX1P39880 1505 aa22.1■■□□□ 1.13
MDM4-208ENST00000462012 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MDM4-208ENST00000462012 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
MDM4-208ENST00000462012 SOGA1O94964 1423 aa22.03■■□□□ 1.12
MDM4-208ENST00000462012 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.03■■□□□ 1.12
MDM4-208ENST00000462012 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
MDM4-208ENST00000462012 WDR97A6NE52 1622 aa21.98■■□□□ 1.11
MDM4-208ENST00000462012 TOP2BQ02880 1626 aa21.98■■□□□ 1.11
MDM4-208ENST00000462012 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.95■■□□□ 1.1
MDM4-208ENST00000462012 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
MDM4-208ENST00000462012 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.93■■□□□ 1.1
MDM4-208ENST00000462012 SYNJ1O43426 1573 aa21.89■■□□□ 1.09
MDM4-208ENST00000462012 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MDM4-208ENST00000462012 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.88■■□□□ 1.09
MDM4-208ENST00000462012 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.88■■□□□ 1.09
MDM4-208ENST00000462012 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
MDM4-208ENST00000462012 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
MDM4-208ENST00000462012 GRIN2BQ13224 1484 aa21.78■■□□□ 1.08
MDM4-208ENST00000462012 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.77■■□□□ 1.07
MDM4-208ENST00000462012 OSCARQ8IYS5 282 aa21.74■■□□□ 1.07
MDM4-208ENST00000462012 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
MDM4-208ENST00000462012 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.73■■□□□ 1.07
MDM4-208ENST00000462012 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.66■■□□□ 1.06
MDM4-208ENST00000462012 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.64■■□□□ 1.05
MDM4-208ENST00000462012 SYNJ2O15056 1496 aa21.63■■□□□ 1.05
MDM4-208ENST00000462012 PBRM1Q86U86 1689 aa21.63■■□□□ 1.05
MDM4-208ENST00000462012 KIF27Q86VH2 1401 aa21.61■■□□□ 1.05
MDM4-208ENST00000462012 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
MDM4-208ENST00000462012 FBLN2P98095 1184 aa21.56■■□□□ 1.04
MDM4-208ENST00000462012 TRIM41Q8WV44 630 aa21.56■■□□□ 1.04
MDM4-208ENST00000462012 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.55■■□□□ 1.04
MDM4-208ENST00000462012 CHD1O14646 1710 aa21.55■■□□□ 1.04
MDM4-208ENST00000462012 ADAMTS12P58397 1594 aa21.51■■□□□ 1.03
MDM4-208ENST00000462012 IGF1RP08069 1367 aa21.49■■□□□ 1.03
MDM4-208ENST00000462012 GRIN2AQ12879 1464 aa21.47■■□□□ 1.03
MDM4-208ENST00000462012 CUL7Q14999 1698 aa21.42■■□□□ 1.02
MDM4-208ENST00000462012 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.41■■□□□ 1.02
MDM4-208ENST00000462012 NUP160Q12769 1436 aa21.4■■□□□ 1.02
MDM4-208ENST00000462012 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.36■■□□□ 1.01
MDM4-208ENST00000462012 ARHGEF11O15085 1522 aa21.31■■□□□ 1
MDM4-208ENST00000462012 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.31■■□□□ 1
MDM4-208ENST00000462012 CEP170Q5SW79 1584 aa21.31■■□□□ 1
MDM4-208ENST00000462012 EEA1Q15075 1411 aa21.3■■□□□ 1
MDM4-208ENST00000462012 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.28■■□□□ 1
MDM4-208ENST00000462012 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
MDM4-208ENST00000462012 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
MDM4-208ENST00000462012 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.26■□□□□ 0.99
MDM4-208ENST00000462012 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.25■□□□□ 0.99
MDM4-208ENST00000462012 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.24■□□□□ 0.99
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