Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUCB2P80303 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms