Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PTPRM-214ENST00000583153 713 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 37.2
SF3B4Q15427 AP2M1-219ENST00000484469 558 ntTSL 316.32■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 37.2
SF3B4Q15427 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 34.43□□□□□ -1.76e-24■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 GGCX-207ENST00000473665 869 ntTSL 211.31□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 MTRF1-201ENST00000239852 1561 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 MTRF1-209ENST00000497679 863 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 MTRF1-205ENST00000452359 820 ntTSL 35.03□□□□□ -1.62e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 MTRF1-208ENST00000492827 618 ntTSL 34.82□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 321.04■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 520.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 515.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 515.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 214.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SSBP4-208ENST00000600628 550 ntTSL 37.93□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 23.82□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 PLOD3-208ENST00000460132 578 ntTSL 313.27□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 PLOD3-205ENST00000440925 536 ntTSL 413.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 417.19■□□□□ 0.348e-21■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 415.02■□□□□ -08e-21■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 47.99□□□□□ -1.138e-21■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 PPP6R1-207ENST00000591602 520 ntTSL 514.67□□□□□ -0.066e-10■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 A2M-203ENST00000462568 546 ntTSL 23.53□□□□□ -1.848e-22■■■■■ 37.1
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SF3B4Q15427 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 413.94□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 AMBRA1-210ENST00000531542 561 ntTSL 312.23□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 210.96□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 37.1
SF3B4Q15427 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MUS81-209ENST00000529786 759 ntTSL 315□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 322.22■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM237-204ENST00000432684 1071 ntTSL 522.08■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM248-207ENST00000607045 690 ntTSL 319.89■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ANO8-202ENST00000597643 4618 ntTSL 219.88■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-213ENST00000590775 582 ntTSL 518.71■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CLCN7-213ENST00000567836 647 ntTSL 218.26■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FN3K-205ENST00000574496 594 ntTSL 318.25■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 FN3K-204ENST00000573841 513 ntTSL 217.83■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 37
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SF3B4Q15427 SNX2-202ENST00000505854 908 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 P3H1-203ENST00000372526 654 ntTSL 316.48■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 37
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SF3B4Q15427 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 37
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SF3B4Q15427 ZNF783-204ENST00000481519 1929 ntTSL 214.05□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 37
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SF3B4Q15427 SNX2-203ENST00000505934 819 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 37
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SF3B4Q15427 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CCDC18-206ENST00000448243 496 ntTSL 212.52□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EPCAM-204ENST00000456133 1501 ntTSL 512.22□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM237-205ENST00000444047 779 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 TMEM248-203ENST00000418375 545 ntTSL 412.08□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 YIPF6-202ENST00000374643 734 ntTSL 311.98□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-218ENST00000528931 2868 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SEC31B-209ENST00000485800 2217 ntTSL 511.67□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 311.61□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EMG1-203ENST00000611981 1223 ntTSL 211.49□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 HDAC7-223ENST00000485796 724 ntTSL 511.32□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 BRD7-205ENST00000562383 2580 ntTSL 511.25□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 CHKA-203ENST00000525155 1201 ntTSL 511.02□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 37
SF3B4Q15427 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 37
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