RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRM-214ENST00000583153 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRM-214ENST00000583153 ABCC9O60706 1549 aa18.08■□□□□ 0.48
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PTPRM-214ENST00000583153 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.11■□□□□ 0.33
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PTPRM-214ENST00000583153 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRM-214ENST00000583153 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
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PTPRM-214ENST00000583153 SMARCA2P51531 1590 aa15.89■□□□□ 0.13
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PTPRM-214ENST00000583153 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.27■□□□□ 0.04
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PTPRM-214ENST00000583153 CUX1P39880 1505 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRM-214ENST00000583153 WDR97A6NE52 1622 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRM-214ENST00000583153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRM-214ENST00000583153 CHD1O14646 1710 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRM-214ENST00000583153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.77□□□□□ -0.04
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PTPRM-214ENST00000583153 PBRM1Q86U86 1689 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRM-214ENST00000583153 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.71□□□□□ -0.05
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PTPRM-214ENST00000583153 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRM-214ENST00000583153 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRM-214ENST00000583153 TOP2BQ02880 1626 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-214ENST00000583153 POTEDQ86YR6 584 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-214ENST00000583153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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PTPRM-214ENST00000583153 SYNJ1O43426 1573 aa14.67□□□□□ -0.06
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PTPRM-214ENST00000583153 GRIN2BQ13224 1484 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS12P58397 1594 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRM-214ENST00000583153 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRM-214ENST00000583153 ARAP1Q96P48 1450 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRM-214ENST00000583153 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRM-214ENST00000583153 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-214ENST00000583153 GRIN2AQ12879 1464 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRM-214ENST00000583153 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRM-214ENST00000583153 CEP170Q5SW79 1584 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRM-214ENST00000583153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.41□□□□□ -0.1
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