Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.593e-8■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ZRANB2-204ENST00000477096 3677 ntTSL 1 (best)1.94□□□□□ -2.13e-8■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.791e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-8■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 224.68■■□□□ 1.542e-10■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.182e-10■□□□□ 11.3
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NOLC1Q14978 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 311.64□□□□□ -0.552e-11■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.885e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.455e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 316.3■□□□□ 0.25e-10■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.185e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 KPNB1-214ENST00000583648 896 ntTSL 415.94■□□□□ 0.145e-10■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 RREB1-208ENST00000483150 2833 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 05e-7■□□□□ 11.3
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NOLC1Q14978 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 514.45□□□□□ -0.15e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.885e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 CCT6A-209ENST00000494736 411 ntTSL 27.84□□□□□ -1.155e-10■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 KPNB1-204ENST00000577875 605 ntTSL 34.88□□□□□ -1.635e-10■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.223e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 524.4■■□□□ 1.53e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 521.98■■□□□ 1.113e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 220.02■□□□□ 0.83e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 316.42■□□□□ 0.223e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 316.25■□□□□ 0.193e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.043e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 511.39□□□□□ -0.593e-79■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.888e-9■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.788e-9■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 318.1■□□□□ 0.498e-9■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 HMBOX1-209ENST00000522468 817 ntTSL 315.38■□□□□ 0.058e-9■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 A2M-213ENST00000546069 593 ntTSL 57.57□□□□□ -1.24e-56■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 CES1-206ENST00000565403 540 ntTSL 519.93■□□□□ 0.783e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 CES1-204ENST00000563005 1002 ntTSL 514.54□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 11.3
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NOLC1Q14978 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.356e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.436e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.456e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.496e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.76e-51■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 GARS-209ENST00000496643 772 ntTSL 25.81□□□□□ -1.484e-7■□□□□ 11.3
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NOLC1Q14978 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.572e-8■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 513.56□□□□□ -0.242e-8■□□□□ 11.3
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NOLC1Q14978 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.153e-8■□□□□ 11.3
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NOLC1Q14978 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 411.77□□□□□ -0.533e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-231ENST00000584054 716 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 210.47□□□□□ -0.731e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 SNORA48-201ENST00000386847 135 ntBASIC10.43□□□□□ -0.741e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-234ENST00000584798 1440 nt9.92□□□□□ -0.821e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 49.59□□□□□ -0.871e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 36.83□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 EIF4A1-224ENST00000582213 560 ntTSL 44.19□□□□□ -1.741e-323■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 FN1-213ENST00000456923 3720 ntTSL 27.94□□□□□ -1.141e-50■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 FN1-224ENST00000492816 9171 ntTSL 56.15□□□□□ -1.421e-50■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-208ENST00000531189 577 ntTSL 221.19■□□□□ 0.981e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.711e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-209ENST00000531418 585 ntTSL 319.11■□□□□ 0.651e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 218.48■□□□□ 0.551e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.08■□□□□ 0.491e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.59■□□□□ 0.411e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.311e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 216.88■□□□□ 0.291e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 416.82■□□□□ 0.281e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.231e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.4□□□□□ -0.261e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.65□□□□□ -0.71e-10■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 216.6■□□□□ 0.255e-11■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.375e-11■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 PDIA3-204ENST00000455250 725 ntTSL 58.91□□□□□ -0.985e-11■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 CDK10-209ENST00000505733 1703 ntTSL 218.96■□□□□ 0.634e-6■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 CDK10-204ENST00000472018 2532 ntTSL 218.89■□□□□ 0.614e-6■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.284e-6■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.724e-6■□□□□ 11.2
NOLC1Q14978 RBM5-212ENST00000464087 5616 ntTSL 29.3□□□□□ -0.924e-6■□□□□ 11.2
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