Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT3P12035 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT3P12035 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT3P12035 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT3P12035 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT3P12035 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT3P12035 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms