RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532505.1

HTATIP2-208, Transcript of HIV-1 Tat interactive protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HTATIP2, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATIP2-208ENST00000532505 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.49■■■■■ 5.67
HTATIP2-208ENST00000532505 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.67■■■■■ 4.74
HTATIP2-208ENST00000532505 ABCC9O60706 1549 aa43.76■■■■■ 4.6
HTATIP2-208ENST00000532505 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.42■■■■■ 4.38
HTATIP2-208ENST00000532505 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
HTATIP2-208ENST00000532505 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.04■■■■■ 4.32
HTATIP2-208ENST00000532505 NACADO15069 1562 aa42.01■■■■■ 4.32
HTATIP2-208ENST00000532505 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.74■■■■■ 4.27
HTATIP2-208ENST00000532505 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.67■■■■■ 4.26
HTATIP2-208ENST00000532505 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.05■■■■■ 4.16
HTATIP2-208ENST00000532505 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.16
HTATIP2-208ENST00000532505 SCRIBQ14160 1630 aa40.96■■■■■ 4.15
HTATIP2-208ENST00000532505 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.77■■■■■ 4.12
HTATIP2-208ENST00000532505 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.26■■■■■ 4.03
HTATIP2-208ENST00000532505 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.04■■■■■ 4
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HTATIP2-208ENST00000532505 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.5■■■■□ 3.91
HTATIP2-208ENST00000532505 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.4■■■■□ 3.9
HTATIP2-208ENST00000532505 SMARCA4P51532 1647 aa39.11■■■■□ 3.85
HTATIP2-208ENST00000532505 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
HTATIP2-208ENST00000532505 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.97■■■■□ 3.83
HTATIP2-208ENST00000532505 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.89■■■■□ 3.82
HTATIP2-208ENST00000532505 SMARCA2P51531 1590 aa38.8■■■■□ 3.8
HTATIP2-208ENST00000532505 NCAPD3P42695 1498 aa38.79■■■■□ 3.8
HTATIP2-208ENST00000532505 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.64■■■■□ 3.78
HTATIP2-208ENST00000532505 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
HTATIP2-208ENST00000532505 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
HTATIP2-208ENST00000532505 HMGXB3Q12766 1538 aa38.57■■■■□ 3.76
HTATIP2-208ENST00000532505 WIZO95785 1651 aa38.55■■■■□ 3.76
HTATIP2-208ENST00000532505 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
HTATIP2-208ENST00000532505 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
HTATIP2-208ENST00000532505 NESP48681 1621 aa37.92■■■■□ 3.66
HTATIP2-208ENST00000532505 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.74■■■■□ 3.63
HTATIP2-208ENST00000532505 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.72■■■■□ 3.63
HTATIP2-208ENST00000532505 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.71■■■■□ 3.63
HTATIP2-208ENST00000532505 ERCC6Q03468 1493 aa37.69■■■■□ 3.62
HTATIP2-208ENST00000532505 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.53■■■■□ 3.6
HTATIP2-208ENST00000532505 CFTRP13569 1480 aa37.52■■■■□ 3.6
HTATIP2-208ENST00000532505 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.38■■■■□ 3.57
HTATIP2-208ENST00000532505 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.31■■■■□ 3.56
HTATIP2-208ENST00000532505 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.23■■■■□ 3.55
HTATIP2-208ENST00000532505 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
HTATIP2-208ENST00000532505 PRDM2Q13029 1718 aa37.13■■■■□ 3.53
HTATIP2-208ENST00000532505 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.13■■■■□ 3.53
HTATIP2-208ENST00000532505 CUX2O14529 1486 aa37.08■■■■□ 3.53
HTATIP2-208ENST00000532505 WDR62O43379 1518 aa36.93■■■■□ 3.5
HTATIP2-208ENST00000532505 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
HTATIP2-208ENST00000532505 TOPBP1Q92547 1522 aa36.72■■■■□ 3.47
HTATIP2-208ENST00000532505 ABCC8Q09428 1581 aa36.67■■■■□ 3.46
HTATIP2-208ENST00000532505 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.66■■■■□ 3.46
HTATIP2-208ENST00000532505 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.54■■■■□ 3.44
HTATIP2-208ENST00000532505 CUX1P39880 1505 aa36.53■■■■□ 3.44
HTATIP2-208ENST00000532505 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
HTATIP2-208ENST00000532505 IFT140Q96RY7 1462 aa36.42■■■■□ 3.42
HTATIP2-208ENST00000532505 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.39■■■■□ 3.42
HTATIP2-208ENST00000532505 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
HTATIP2-208ENST00000532505 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.34■■■■□ 3.41
HTATIP2-208ENST00000532505 SOGA1O94964 1423 aa36.34■■■■□ 3.41
HTATIP2-208ENST00000532505 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
HTATIP2-208ENST00000532505 SYNJ1O43426 1573 aa36.27■■■■□ 3.4
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HTATIP2-208ENST00000532505 TOP2BQ02880 1626 aa36.21■■■■□ 3.39
HTATIP2-208ENST00000532505 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.18■■■■□ 3.38
HTATIP2-208ENST00000532505 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.381e-6■■■■■ 33.8
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HTATIP2-208ENST00000532505 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
HTATIP2-208ENST00000532505 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.98■■■■□ 3.35
HTATIP2-208ENST00000532505 WDR97A6NE52 1622 aa35.95■■■■□ 3.35
HTATIP2-208ENST00000532505 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.89■■■■□ 3.34
HTATIP2-208ENST00000532505 GRIN2BQ13224 1484 aa35.84■■■■□ 3.33
HTATIP2-208ENST00000532505 FBLN2P98095 1184 aa35.82■■■■□ 3.32
HTATIP2-208ENST00000532505 TRIM41Q8WV44 630 aa35.81■■■■□ 3.32
HTATIP2-208ENST00000532505 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.79■■■■□ 3.32
HTATIP2-208ENST00000532505 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.79■■■■□ 3.32
HTATIP2-208ENST00000532505 OSCARQ8IYS5 282 aa35.75■■■■□ 3.31
HTATIP2-208ENST00000532505 PBRM1Q86U86 1689 aa35.72■■■■□ 3.31
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HTATIP2-208ENST00000532505 KIF27Q86VH2 1401 aa35.62■■■■□ 3.29
HTATIP2-208ENST00000532505 CHD1O14646 1710 aa35.6■■■■□ 3.29
HTATIP2-208ENST00000532505 SYNJ2O15056 1496 aa35.55■■■■□ 3.28
HTATIP2-208ENST00000532505 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.54■■■■□ 3.28
HTATIP2-208ENST00000532505 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.49■■■■□ 3.27
HTATIP2-208ENST00000532505 IGF1RP08069 1367 aa35.47■■■■□ 3.27
HTATIP2-208ENST00000532505 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.46■■■■□ 3.27
HTATIP2-208ENST00000532505 ADAMTS12P58397 1594 aa35.46■■■■□ 3.27
HTATIP2-208ENST00000532505 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.43■■■■□ 3.26
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HTATIP2-208ENST00000532505 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.28■■■■□ 3.24
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HTATIP2-208ENST00000532505 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.19■■■■□ 3.22
HTATIP2-208ENST00000532505 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
HTATIP2-208ENST00000532505 CEP170Q5SW79 1584 aa35.17■■■■□ 3.22
HTATIP2-208ENST00000532505 NUP160Q12769 1436 aa35.17■■■■□ 3.22
HTATIP2-208ENST00000532505 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.08■■■■□ 3.21
HTATIP2-208ENST00000532505 ARHGEF11O15085 1522 aa35.07■■■■□ 3.21
HTATIP2-208ENST00000532505 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.05■■■■□ 3.2
HTATIP2-208ENST00000532505 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.05■■■■□ 3.2
HTATIP2-208ENST00000532505 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.05■■■■□ 3.2
HTATIP2-208ENST00000532505 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.04■■■■□ 3.2
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