RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.67■■■■■ 4.74
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KCNQ1-202ENST00000335475 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.33■■■■□ 3.57
KCNQ1-202ENST00000335475 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.86■■■■□ 3.49
KCNQ1-202ENST00000335475 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.53■■■■□ 3.44
KCNQ1-202ENST00000335475 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
KCNQ1-202ENST00000335475 SCRIBQ14160 1630 aa35.62■■■■□ 3.29
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC9O60706 1549 aa35.6■■■■□ 3.29
KCNQ1-202ENST00000335475 NACADO15069 1562 aa35.48■■■■□ 3.27
KCNQ1-202ENST00000335475 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.35■■■■□ 3.25
KCNQ1-202ENST00000335475 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
KCNQ1-202ENST00000335475 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.94■■■■□ 3.18
KCNQ1-202ENST00000335475 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.74■■■■□ 3.15
KCNQ1-202ENST00000335475 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.64■■■■□ 3.14
KCNQ1-202ENST00000335475 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.51■■■■□ 3.12
KCNQ1-202ENST00000335475 WIZO95785 1651 aa34.44■■■■□ 3.1
KCNQ1-202ENST00000335475 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
KCNQ1-202ENST00000335475 SMARCA4P51532 1647 aa34.16■■■■□ 3.06
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.09■■■■□ 3.05
KCNQ1-202ENST00000335475 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.04■■■■□ 3.04
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM41Q8WV44 630 aa33.99■■■■□ 3.03
KCNQ1-202ENST00000335475 SMARCA2P51531 1590 aa33.78■■■■□ 3
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.71■■■□□ 2.99
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KCNQ1-202ENST00000335475 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.65■■■□□ 2.98
KCNQ1-202ENST00000335475 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.61■■■□□ 2.97
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
KCNQ1-202ENST00000335475 HRCP23327 699 aa33.5■■■□□ 2.95
KCNQ1-202ENST00000335475 ABCC8Q09428 1581 aa33.44■■■□□ 2.94
KCNQ1-202ENST00000335475 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.3■■■□□ 2.92
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
KCNQ1-202ENST00000335475 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
KCNQ1-202ENST00000335475 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.09■■■□□ 2.89
KCNQ1-202ENST00000335475 SOGA1O94964 1423 aa32.99■■■□□ 2.87
KCNQ1-202ENST00000335475 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.96■■■□□ 2.87
KCNQ1-202ENST00000335475 EEA1Q15075 1411 aa32.94■■■□□ 2.86
KCNQ1-202ENST00000335475 SYNJ1O43426 1573 aa32.9■■■□□ 2.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.85■■■□□ 2.85
KCNQ1-202ENST00000335475 HMGXB3Q12766 1538 aa32.84■■■□□ 2.85
KCNQ1-202ENST00000335475 NCAPD3P42695 1498 aa32.77■■■□□ 2.84
KCNQ1-202ENST00000335475 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.71■■■□□ 2.83
KCNQ1-202ENST00000335475 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.7■■■□□ 2.83
KCNQ1-202ENST00000335475 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP162Q5TB80 1403 aa32.69■■■□□ 2.82
KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA3Q08378 1498 aa32.63■■■□□ 2.81
KCNQ1-202ENST00000335475 TOP2BQ02880 1626 aa32.6■■■□□ 2.81
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF21BO75037 1637 aa32.59■■■□□ 2.81
KCNQ1-202ENST00000335475 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.56■■■□□ 2.8
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.5■■■□□ 2.79
KCNQ1-202ENST00000335475 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
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KCNQ1-202ENST00000335475 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.14■■■□□ 2.74
KCNQ1-202ENST00000335475 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.13■■■□□ 2.73
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KCNQ1-202ENST00000335475 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.03■■■□□ 2.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.01■■■□□ 2.71
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF27Q86VH2 1401 aa31.98■■■□□ 2.71
KCNQ1-202ENST00000335475 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
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KCNQ1-202ENST00000335475 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.76■■■□□ 2.67
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KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.57■■■□□ 2.64
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KCNQ1-202ENST00000335475 NESP48681 1621 aa31.55■■■□□ 2.64
KCNQ1-202ENST00000335475 TOPBP1Q92547 1522 aa31.51■■■□□ 2.63
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KCNQ1-202ENST00000335475 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.46■■■□□ 2.63
KCNQ1-202ENST00000335475 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
KCNQ1-202ENST00000335475 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.4■■■□□ 2.62
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KCNQ1-202ENST00000335475 TIAM1Q13009 1591 aa31.21■■■□□ 2.59
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KCNQ1-202ENST00000335475 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.17■■■□□ 2.58
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KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.15■■■□□ 2.58
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.11■■■□□ 2.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
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