Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A4GALTQ9NPC4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A4GALTQ9NPC4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms