RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.66■■■■■ 4.9
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CTU2-210ENST00000567949 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.74■■■■□ 3.63
CTU2-210ENST00000567949 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.63■■■■□ 3.61
CTU2-210ENST00000567949 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.51■■■■□ 3.6
CTU2-210ENST00000567949 ABCC9O60706 1549 aa37.21■■■■□ 3.55
CTU2-210ENST00000567949 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.17■■■■□ 3.54
CTU2-210ENST00000567949 NACADO15069 1562 aa36.85■■■■□ 3.49
CTU2-210ENST00000567949 SCRIBQ14160 1630 aa36.52■■■■□ 3.44
CTU2-210ENST00000567949 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.45■■■■□ 3.43
CTU2-210ENST00000567949 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
CTU2-210ENST00000567949 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.73■■■■□ 3.31
CTU2-210ENST00000567949 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CTU2-210ENST00000567949 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.47■■■■□ 3.27
CTU2-210ENST00000567949 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.37■■■■□ 3.25
CTU2-210ENST00000567949 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.3■■■■□ 3.24
CTU2-210ENST00000567949 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
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CTU2-210ENST00000567949 WIZO95785 1651 aa35.03■■■■□ 3.2
CTU2-210ENST00000567949 SMARCA4P51532 1647 aa35.02■■■■□ 3.2
CTU2-210ENST00000567949 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.89■■■■□ 3.18
CTU2-210ENST00000567949 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
CTU2-210ENST00000567949 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.58■■■■□ 3.13
CTU2-210ENST00000567949 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.37■■■■□ 3.09
CTU2-210ENST00000567949 SMARCA2P51531 1590 aa34.36■■■■□ 3.09
CTU2-210ENST00000567949 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.33■■■■□ 3.09
CTU2-210ENST00000567949 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
CTU2-210ENST00000567949 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
CTU2-210ENST00000567949 TRIM41Q8WV44 630 aa34.06■■■■□ 3.04
CTU2-210ENST00000567949 NCAPD3P42695 1498 aa34.02■■■■□ 3.04
CTU2-210ENST00000567949 HMGXB3Q12766 1538 aa33.98■■■■□ 3.03
CTU2-210ENST00000567949 ABCC8Q09428 1581 aa33.71■■■□□ 2.99
CTU2-210ENST00000567949 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.68■■■□□ 2.98
CTU2-210ENST00000567949 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.58■■■□□ 2.97
CTU2-210ENST00000567949 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
CTU2-210ENST00000567949 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.46■■■□□ 2.955e-6■■■■■ 29.2
CTU2-210ENST00000567949 CFTRP13569 1480 aa33.36■■■□□ 2.93
CTU2-210ENST00000567949 SYNJ1O43426 1573 aa33.31■■■□□ 2.92
CTU2-210ENST00000567949 PRDM2Q13029 1718 aa33.18■■■□□ 2.9
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CTU2-210ENST00000567949 SOGA1O94964 1423 aa33.17■■■□□ 2.9
CTU2-210ENST00000567949 EEA1Q15075 1411 aa33.15■■■□□ 2.9
CTU2-210ENST00000567949 TOP2BQ02880 1626 aa33.14■■■□□ 2.9
CTU2-210ENST00000567949 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.1■■■□□ 2.89
CTU2-210ENST00000567949 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.03■■■□□ 2.88
CTU2-210ENST00000567949 CUX1P39880 1505 aa32.99■■■□□ 2.87
CTU2-210ENST00000567949 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.98■■■□□ 2.87
CTU2-210ENST00000567949 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.96■■■□□ 2.87
CTU2-210ENST00000567949 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.81■■■□□ 2.84
CTU2-210ENST00000567949 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.79■■■□□ 2.84
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CTU2-210ENST00000567949 KIF21BO75037 1637 aa32.7■■■□□ 2.83
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CTU2-210ENST00000567949 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.68■■■□□ 2.82
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CTU2-210ENST00000567949 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.57■■■□□ 2.8
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CTU2-210ENST00000567949 CEP162Q5TB80 1403 aa32.53■■■□□ 2.8
CTU2-210ENST00000567949 TOPBP1Q92547 1522 aa32.49■■■□□ 2.79
CTU2-210ENST00000567949 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.47■■■□□ 2.79
CTU2-210ENST00000567949 PRXQ9BXM0 1461 aa32.45■■■□□ 2.79
CTU2-210ENST00000567949 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.42■■■□□ 2.78
CTU2-210ENST00000567949 CUX2O14529 1486 aa32.42■■■□□ 2.78
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CTU2-210ENST00000567949 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.38■■■□□ 2.77
CTU2-210ENST00000567949 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.37■■■□□ 2.77
CTU2-210ENST00000567949 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
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CTU2-210ENST00000567949 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.27■■■□□ 2.76
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CTU2-210ENST00000567949 CLIP1P30622 1438 aa32.2■■■□□ 2.75
CTU2-210ENST00000567949 WDR97A6NE52 1622 aa32.14■■■□□ 2.74
CTU2-210ENST00000567949 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.11■■■□□ 2.73
CTU2-210ENST00000567949 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.1■■■□□ 2.73
CTU2-210ENST00000567949 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.99■■■□□ 2.71
CTU2-210ENST00000567949 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
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CTU2-210ENST00000567949 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.97■■■□□ 2.71
CTU2-210ENST00000567949 CUL7Q14999 1698 aa31.96■■■□□ 2.71
CTU2-210ENST00000567949 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CTU2-210ENST00000567949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
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CTU2-210ENST00000567949 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.91■■■□□ 2.7
CTU2-210ENST00000567949 ERCC6Q03468 1493 aa31.86■■■□□ 2.69
CTU2-210ENST00000567949 ARAP1Q96P48 1450 aa31.86■■■□□ 2.69
CTU2-210ENST00000567949 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.79■■■□□ 2.68
CTU2-210ENST00000567949 IFT140Q96RY7 1462 aa31.76■■■□□ 2.68
CTU2-210ENST00000567949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CTU2-210ENST00000567949 HRCP23327 699 aa31.73■■■□□ 2.67
CTU2-210ENST00000567949 PBRM1Q86U86 1689 aa31.7■■■□□ 2.66
CTU2-210ENST00000567949 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.661e-7■■■■■ 27.3
CTU2-210ENST00000567949 APLP2Q06481 763 aa31.66■■■□□ 2.66
CTU2-210ENST00000567949 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.66■■■□□ 2.66
CTU2-210ENST00000567949 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
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