RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619917.4

POLR2E-214, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene POLR2E, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-214ENST00000619917 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53■■■■■ 6.07
POLR2E-214ENST00000619917 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.11■■■■■ 5.13
POLR2E-214ENST00000619917 ABCC9O60706 1549 aa46.43■■■■■ 5.02
POLR2E-214ENST00000619917 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.47■■■■■ 4.71
POLR2E-214ENST00000619917 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.43■■■■■ 4.7
POLR2E-214ENST00000619917 NACADO15069 1562 aa44.38■■■■■ 4.69
POLR2E-214ENST00000619917 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
POLR2E-214ENST00000619917 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.03■■■■■ 4.64
POLR2E-214ENST00000619917 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.78■■■■■ 4.6
POLR2E-214ENST00000619917 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.49■■■■■ 4.55
POLR2E-214ENST00000619917 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
POLR2E-214ENST00000619917 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.22■■■■■ 4.51
POLR2E-214ENST00000619917 SCRIBQ14160 1630 aa43.06■■■■■ 4.48
POLR2E-214ENST00000619917 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.91■■■■■ 4.46
POLR2E-214ENST00000619917 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.61■■■■■ 4.41
POLR2E-214ENST00000619917 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
POLR2E-214ENST00000619917 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.95■■■■■ 4.31
POLR2E-214ENST00000619917 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.71■■■■■ 4.27
POLR2E-214ENST00000619917 SMARCA4P51532 1647 aa41.15■■■■■ 4.18
POLR2E-214ENST00000619917 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
POLR2E-214ENST00000619917 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.02■■■■■ 4.16
POLR2E-214ENST00000619917 NCAPD3P42695 1498 aa41.01■■■■■ 4.16
POLR2E-214ENST00000619917 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.88■■■■■ 4.13
POLR2E-214ENST00000619917 SMARCA2P51531 1590 aa40.87■■■■■ 4.13
POLR2E-214ENST00000619917 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.73■■■■■ 4.11
POLR2E-214ENST00000619917 HMGXB3Q12766 1538 aa40.72■■■■■ 4.11
POLR2E-214ENST00000619917 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
POLR2E-214ENST00000619917 WIZO95785 1651 aa40.41■■■■■ 4.06
POLR2E-214ENST00000619917 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
POLR2E-214ENST00000619917 NESP48681 1621 aa40.14■■■■■ 4.02
POLR2E-214ENST00000619917 ERCC6Q03468 1493 aa39.96■■■■□ 3.99
POLR2E-214ENST00000619917 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
POLR2E-214ENST00000619917 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.89■■■■□ 3.98
POLR2E-214ENST00000619917 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.81■■■■□ 3.96
POLR2E-214ENST00000619917 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.65■■■■□ 3.94
POLR2E-214ENST00000619917 CUX2O14529 1486 aa39.6■■■■□ 3.93
POLR2E-214ENST00000619917 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.58■■■■□ 3.93
POLR2E-214ENST00000619917 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.52■■■■□ 3.92
POLR2E-214ENST00000619917 CFTRP13569 1480 aa39.52■■■■□ 3.92
POLR2E-214ENST00000619917 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
POLR2E-214ENST00000619917 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.34■■■■□ 3.89
POLR2E-214ENST00000619917 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.29■■■■□ 3.88
POLR2E-214ENST00000619917 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.29■■■■□ 3.88
POLR2E-214ENST00000619917 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
POLR2E-214ENST00000619917 WDR62O43379 1518 aa39.15■■■■□ 3.86
POLR2E-214ENST00000619917 PRDM2Q13029 1718 aa39.09■■■■□ 3.85
POLR2E-214ENST00000619917 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
POLR2E-214ENST00000619917 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.71■■■■□ 3.79
POLR2E-214ENST00000619917 TOPBP1Q92547 1522 aa38.69■■■■□ 3.78
POLR2E-214ENST00000619917 ABCC8Q09428 1581 aa38.61■■■■□ 3.77
POLR2E-214ENST00000619917 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.6■■■■□ 3.77
POLR2E-214ENST00000619917 IFT140Q96RY7 1462 aa38.47■■■■□ 3.75
POLR2E-214ENST00000619917 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
POLR2E-214ENST00000619917 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
POLR2E-214ENST00000619917 CUX1P39880 1505 aa38.35■■■■□ 3.73
POLR2E-214ENST00000619917 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
POLR2E-214ENST00000619917 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.24■■■■□ 3.71
POLR2E-214ENST00000619917 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.24■■■■□ 3.71
POLR2E-214ENST00000619917 SOGA1O94964 1423 aa38.21■■■■□ 3.71
POLR2E-214ENST00000619917 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.72e-7■■■■□ 26
POLR2E-214ENST00000619917 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
POLR2E-214ENST00000619917 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
POLR2E-214ENST00000619917 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38■■■■□ 3.67
POLR2E-214ENST00000619917 OSCARQ8IYS5 282 aa37.98■■■■□ 3.67
POLR2E-214ENST00000619917 SYNJ1O43426 1573 aa37.94■■■■□ 3.66
POLR2E-214ENST00000619917 TOP2BQ02880 1626 aa37.91■■■■□ 3.66
POLR2E-214ENST00000619917 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.9■■■■□ 3.66
POLR2E-214ENST00000619917 WDR97A6NE52 1622 aa37.88■■■■□ 3.65
POLR2E-214ENST00000619917 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.83■■■■□ 3.65
POLR2E-214ENST00000619917 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.76■■■■□ 3.63
POLR2E-214ENST00000619917 GRIN2BQ13224 1484 aa37.75■■■■□ 3.63
POLR2E-214ENST00000619917 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.74■■■■□ 3.63
POLR2E-214ENST00000619917 FBLN2P98095 1184 aa37.72■■■■□ 3.63
POLR2E-214ENST00000619917 CHD1O14646 1710 aa37.71■■■■□ 3.63
POLR2E-214ENST00000619917 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.69■■■■□ 3.62
POLR2E-214ENST00000619917 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
POLR2E-214ENST00000619917 PBRM1Q86U86 1689 aa37.63■■■■□ 3.61
POLR2E-214ENST00000619917 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
POLR2E-214ENST00000619917 SYNJ2O15056 1496 aa37.52■■■■□ 3.6
POLR2E-214ENST00000619917 TRIM41Q8WV44 630 aa37.38■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 ARHGEF11O15085 1522 aa37.36■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 ADAMTS12P58397 1594 aa37.35■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.35■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.32■■■■□ 3.57
POLR2E-214ENST00000619917 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.29■■■■□ 3.56
POLR2E-214ENST00000619917 GRIN2AQ12879 1464 aa37.27■■■■□ 3.56
POLR2E-214ENST00000619917 KIF27Q86VH2 1401 aa37.2■■■■□ 3.55
POLR2E-214ENST00000619917 IGF1RP08069 1367 aa37.15■■■■□ 3.54
POLR2E-214ENST00000619917 NUP160Q12769 1436 aa37.13■■■■□ 3.53
POLR2E-214ENST00000619917 CEP170Q5SW79 1584 aa37.12■■■■□ 3.53
POLR2E-214ENST00000619917 ARAP1Q96P48 1450 aa37.07■■■■□ 3.53
POLR2E-214ENST00000619917 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.07■■■■□ 3.52
POLR2E-214ENST00000619917 CUL7Q14999 1698 aa36.94■■■■□ 3.5
POLR2E-214ENST00000619917 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.93■■■■□ 3.5
POLR2E-214ENST00000619917 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.9■■■■□ 3.5
POLR2E-214ENST00000619917 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.87■■■■□ 3.49
POLR2E-214ENST00000619917 SHROOM2Q13796 1616 aa36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 327.6 ms