Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DEFA6Q01524 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms