Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DEFA6Q01524 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEFA6Q01524 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEFA6Q01524 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEFA6Q01524 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DEFA6Q01524 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DEFA6Q01524 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEFA6Q01524 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEFA6Q01524 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEFA6Q01524 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEFA6Q01524 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEFA6Q01524 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEFA6Q01524 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEFA6Q01524 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEFA6Q01524 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEFA6Q01524 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEFA6Q01524 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEFA6Q01524 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DEFA6Q01524 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DEFA6Q01524 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DEFA6Q01524 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DEFA6Q01524 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DEFA6Q01524 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DEFA6Q01524 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEFA6Q01524 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEFA6Q01524 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEFA6Q01524 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEFA6Q01524 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEFA6Q01524 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEFA6Q01524 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEFA6Q01524 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DEFA6Q01524 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DEFA6Q01524 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DEFA6Q01524 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEFA6Q01524 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DEFA6Q01524 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DEFA6Q01524 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DEFA6Q01524 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DEFA6Q01524 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEFA6Q01524 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFA6Q01524 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFA6Q01524 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEFA6Q01524 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEFA6Q01524 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEFA6Q01524 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEFA6Q01524 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEFA6Q01524 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEFA6Q01524 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEFA6Q01524 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEFA6Q01524 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DEFA6Q01524 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEFA6Q01524 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DEFA6Q01524 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DEFA6Q01524 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DEFA6Q01524 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFA6Q01524 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEFA6Q01524 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEFA6Q01524 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DEFA6Q01524 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEFA6Q01524 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DEFA6Q01524 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DEFA6Q01524 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEFA6Q01524 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEFA6Q01524 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEFA6Q01524 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEFA6Q01524 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEFA6Q01524 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEFA6Q01524 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEFA6Q01524 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEFA6Q01524 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEFA6Q01524 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DEFA6Q01524 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEFA6Q01524 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA6Q01524 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DEFA6Q01524 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEFA6Q01524 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEFA6Q01524 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEFA6Q01524 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEFA6Q01524 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEFA6Q01524 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEFA6Q01524 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEFA6Q01524 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEFA6Q01524 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEFA6Q01524 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEFA6Q01524 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA6Q01524 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEFA6Q01524 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA6Q01524 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEFA6Q01524 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEFA6Q01524 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEFA6Q01524 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms