Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MARS-214ENST00000548714 567 ntTSL 221.12■□□□□ 0.974e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-232ENST00000553162 575 ntTSL 221.12■□□□□ 0.974e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-208ENST00000547501 510 ntTSL 220.31■□□□□ 0.844e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-225ENST00000551842 662 ntTSL 220.3■□□□□ 0.844e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-221ENST00000550449 739 ntTSL 319.3■□□□□ 0.684e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-222ENST00000570063 1821 ntTSL 519.25■□□□□ 0.677e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SLC6A6-211ENST00000622810 565 ntTSL 418.38■□□□□ 0.537e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.57e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.325e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.327e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.315e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.35e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.297e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-208ENST00000572619 495 ntTSL 416.6■□□□□ 0.252e-8■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 EEF1B2-210ENST00000479587 701 ntTSL 215.74■□□□□ 0.115e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 515.25■□□□□ 0.032e-8■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 315.2■□□□□ 0.027e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.075e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-216ENST00000568212 570 ntTSL 414.46□□□□□ -0.097e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-209ENST00000572658 551 ntTSL 213.56□□□□□ -0.242e-8■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 213.5□□□□□ -0.257e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RFK-205ENST00000483155 962 ntTSL 213.04□□□□□ -0.325e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MIR3610-201ENST00000582903 73 ntBASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 EEF1B2-209ENST00000460760 1025 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 411.62□□□□□ -0.557e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 EEF1B2-204ENST00000415904 649 ntTSL 311.3□□□□□ -0.65e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 310.52□□□□□ -0.737e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RFK-206ENST00000490113 2386 ntTSL 210.3□□□□□ -0.765e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 CLTC-203ENST00000466513 793 ntTSL 210□□□□□ -0.815e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-205ENST00000508337 622 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.865e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 NRDC-208ENST00000475715 583 ntTSL 39.25□□□□□ -0.935e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MARS-231ENST00000553123 724 ntTSL 28.48□□□□□ -1.054e-10■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 TARS-206ENST00000504698 633 ntTSL 38.29□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.145e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.185e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 RSRP1-206ENST00000491378 487 ntTSL 37.46□□□□□ -1.227e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.225e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.295e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.295e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-209ENST00000580158 603 ntTSL 26.34□□□□□ -1.392e-8■■■□□ 18.6
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UTP3Q9NQZ2 GYPA-206ENST00000509346 383 ntTSL 55.13□□□□□ -1.595e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.635e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.855e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 CHD4-209ENST00000542717 204 ntTSL 33.47□□□□□ -1.855e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.533e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.963e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 319.33■□□□□ 0.683e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 219.13■□□□□ 0.653e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.063e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.223e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-204ENST00000464612 719 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.863e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.023e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.44□□□□□ -2.183e-38■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 28.59□□□□□ -1.032e-6■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 XPO1-204ENST00000420673 682 ntTSL 28.26□□□□□ -1.091e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 XPO1-205ENST00000422552 382 ntTSL 55.8□□□□□ -1.481e-7■■■□□ 18.6
UTP3Q9NQZ2 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.811e-323■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.831e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-205ENST00000529227 607 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 18.5
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UTP3Q9NQZ2 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-207ENST00000530585 577 ntTSL 210.42□□□□□ -0.741e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-6■■■□□ 18.5
UTP3Q9NQZ2 INSIG1-206ENST00000476756 1320 ntTSL 212.05□□□□□ -0.483e-6■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 INSIG1-205ENST00000468307 852 ntTSL 58.49□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-210ENST00000504549 980 ntTSL 518.14■□□□□ 0.491e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-205ENST00000502632 1509 ntTSL 216.12■□□□□ 0.171e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-236ENST00000519958 885 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 26.34□□□□□ -1.391e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 VAPA-206ENST00000583475 939 ntTSL 27.19□□□□□ -1.269e-8■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 VAPA-207ENST00000583879 719 ntTSL 25.62□□□□□ -1.519e-8■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 EIF4G3-213ENST00000634778 1343 ntTSL 214.69□□□□□ -0.069e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.57■□□□□ 0.723e-7■■■□□ 18.4
UTP3Q9NQZ2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.597e-7■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 212.71□□□□□ -0.383e-6■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.518e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-212ENST00000483980 1015 ntTSL 230.23■■■□□ 2.438e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-208ENST00000455407 837 ntTSL 230.15■■■□□ 2.428e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.428e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.918e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-211ENST00000479237 2794 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.388e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-209ENST00000461811 4828 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.118e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.068e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.238e-8■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 18.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-244ENST00000523136 143 ntTSL 418.14■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 18.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-240ENST00000521720 539 ntTSL 317.49■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 18.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-246ENST00000523449 793 ntTSL 313.73□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 18.2
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-212ENST00000579175 867 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 18.2
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