Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTDSP2O14595 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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