RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.65■■■■□ 3.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34■■■■□ 3.03
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.17■■■□□ 2.74
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.5■■■□□ 2.63
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.27■■■□□ 2.6
RAB11FIP5-201ENST00000258098 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.1■■■□□ 2.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM41Q8WV44 630 aa31.08■■■□□ 2.57
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCC9O60706 1549 aa30.71■■■□□ 2.51
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HRCP23327 699 aa30.33■■■□□ 2.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.33■■■□□ 2.45
RAB11FIP5-201ENST00000258098 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SCRIBQ14160 1630 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB11FIP5-201ENST00000258098 APLP2Q06481 763 aa30■■■□□ 2.39
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.24■■■□□ 2.27
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ITGAEP38570 1179 aa29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP5-201ENST00000258098 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.96■■■□□ 2.23
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NACADO15069 1562 aa28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.86■■■□□ 2.21
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
RAB11FIP5-201ENST00000258098 P3H3Q8IVL6 736 aa28.6■■■□□ 2.17
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WIZO95785 1651 aa28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCC8Q09428 1581 aa28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SOGA1O94964 1423 aa28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CEP162Q5TB80 1403 aa28.41■■■□□ 2.14
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.36■■■□□ 2.13
RAB11FIP5-201ENST00000258098 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NEUROD1Q13562 356 aa28.31■■■□□ 2.12
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARID3CA6NKF2 412 aa28.24■■■□□ 2.11
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CLIP1P30622 1438 aa28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP5-201ENST00000258098 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GOLGA3Q08378 1498 aa28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EEA1Q15075 1411 aa27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FBLN2P98095 1184 aa27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TRIM52Q96A61 297 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMARCA4P51532 1647 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MIER1Q8N108 512 aa27.83■■■□□ 2.05
RAB11FIP5-201ENST00000258098 NEFLP07196 543 aa27.76■■■□□ 2.03
RAB11FIP5-201ENST00000258098 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BCANQ96GW7 911 aa27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SMARCA2P51531 1590 aa27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIF27Q86VH2 1401 aa27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP5-201ENST00000258098 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP5-201ENST00000258098 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.53■■■□□ 2
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CUX2O14529 1486 aa27.53■■■□□ 2
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.49■■□□□ 1.99
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.45■■□□□ 1.99
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANP32CO43423 234 aa27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.42■■□□□ 1.98
RAB11FIP5-201ENST00000258098 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.39■■□□□ 1.97
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TONSLQ96HA7 1378 aa27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP5-201ENST00000258098 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SYNJ1O43426 1573 aa27.22■■□□□ 1.95
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.2■■□□□ 1.94
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.16■■□□□ 1.94
RAB11FIP5-201ENST00000258098 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FKBP8Q14318 412 aa27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP5-201ENST00000258098 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms