Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-208ENST00000554813 654 ntTSL 314.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 214.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 413.94□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-207ENST00000554325 568 ntTSL 513.66□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-217ENST00000557181 566 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-213ENST00000556296 571 ntTSL 413.49□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-204ENST00000471891 578 ntTSL 313.38□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-216ENST00000557159 1803 ntTSL 212.99□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-207ENST00000490672 3264 ntTSL 212.89□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-212ENST00000556054 773 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-209ENST00000492892 430 ntTSL 312.53□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 SREBF2-207ENST00000490262 450 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-210ENST00000497317 477 ntTSL 312.33□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-220ENST00000557592 640 ntTSL 512.21□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-206ENST00000553681 899 ntTSL 312□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 ACO2-206ENST00000481310 330 ntTSL 311.64□□□□□ -0.552e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-208ENST00000491084 598 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 510.71□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-218ENST00000557344 671 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 KRTCAP2-202ENST00000461136 271 ntTSL 34.53□□□□□ -1.682e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-230ENST00000576924 3314 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.619e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-208ENST00000571378 2870 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.19e-7■■■■□ 22
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.62□□□□□ -0.714e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 518.72■□□□□ 0.592e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 315.21■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 58.98□□□□□ -0.972e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.193e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-216ENST00000568331 557 ntTSL 422.46■■□□□ 1.193e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.173e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.093e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-213ENST00000566327 568 ntTSL 420.83■□□□□ 0.933e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-221ENST00000568859 565 ntTSL 416.69■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 212.2□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 29.17□□□□□ -0.943e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 DDB1-212ENST00000538470 858 ntTSL 29.13□□□□□ -0.953e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-209ENST00000563873 368 ntTSL 37.03□□□□□ -1.283e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-207ENST00000563765 855 ntTSL 36.8□□□□□ -1.323e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-217ENST00000568451 573 ntTSL 46.79□□□□□ -1.323e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-204ENST00000561526 565 ntTSL 46.77□□□□□ -1.333e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-211ENST00000566035 846 ntTSL 36.58□□□□□ -1.363e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-218ENST00000568514 1018 ntTSL 36.49□□□□□ -1.373e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-219ENST00000568745 814 ntTSL 55.86□□□□□ -1.473e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.583e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.983e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 513.06□□□□□ -0.323e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-208ENST00000465245 634 ntTSL 312.72□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 TECR-221ENST00000600395 846 ntTSL 324.9■■□□□ 1.586e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt18.02■□□□□ 0.487e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 210.8□□□□□ -0.687e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 38.08□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 21.9
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-231ENST00000510310 584 ntTSL 426.38■■□□□ 1.812e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-223ENST00000507816 546 ntTSL 421.06■□□□□ 0.962e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-221ENST00000507340 587 ntTSL 420.99■□□□□ 0.952e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-225ENST00000507867 682 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-233ENST00000511975 564 ntTSL 418.71■□□□□ 0.592e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-238ENST00000514326 847 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-206ENST00000436790 1717 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.262e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-236ENST00000513323 822 ntTSL 313.96□□□□□ -0.172e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-210ENST00000503058 706 ntTSL 58.91□□□□□ -0.982e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 SEC31A-219ENST00000506497 926 ntTSL 38.81□□□□□ -12e-14■■■■□ 21.8
UTP3Q9NQZ2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.44e-13■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 MED15-206ENST00000420849 430 ntTSL 317.26■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 MED15-219ENST00000457322 623 ntTSL 417.06■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 MED15-209ENST00000428629 572 ntTSL 49.59□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-202ENST00000413787 468 ntTSL 519.13■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 321.88■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 520.45■□□□□ 0.864e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-206ENST00000428595 1419 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-212ENST00000465855 684 ntTSL 310.93□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 210.19□□□□□ -0.786e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)9.58□□□□□ -0.886e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-215ENST00000484696 611 ntTSL 28.5□□□□□ -1.056e-6■■■■□ 21.7
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN1-203ENST00000526477 587 ntTSL 225.16■■□□□ 1.623e-8■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-8■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.247e-9■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.221e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.171e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.861e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.121e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.691e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.021e-10■■■■□ 21.6
UTP3Q9NQZ2 STT3A-205ENST00000525946 1383 ntTSL 28.41□□□□□ -1.061e-10■■■■□ 21.6
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