RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514326.5

SEC31A-238, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, human

TSL 3

Gene SEC31A, Length 847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC31A-238	ENST00000514326	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.54	■■■■□ 3.76
SEC31A-238	ENST00000514326	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.26	■■■■□ 3.07
SEC31A-238	ENST00000514326	ABCC9	O60706	1549 aa		33.89	■■■■□ 3.02
SEC31A-238	ENST00000514326	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SEC31A-238	ENST00000514326	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SEC31A-238	ENST00000514326	NACAD	O15069	1562 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SEC31A-238	ENST00000514326	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SEC31A-238	ENST00000514326	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.01	■■■□□ 2.72
SEC31A-238	ENST00000514326	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SEC31A-238	ENST00000514326	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.71	■■■□□ 2.67
SEC31A-238	ENST00000514326	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SEC31A-238	ENST00000514326	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SEC31A-238	ENST00000514326	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SEC31A-238	ENST00000514326	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SEC31A-238	ENST00000514326	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.02	■■■□□ 2.56
SEC31A-238	ENST00000514326	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.65	■■■□□ 2.5
SEC31A-238	ENST00000514326	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.58	■■■□□ 2.49
SEC31A-238	ENST00000514326	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.45	■■■□□ 2.47
SEC31A-238	ENST00000514326	SMARCA4	P51532	1647 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SEC31A-238	ENST00000514326	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SEC31A-238	ENST00000514326	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SEC31A-238	ENST00000514326	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
SEC31A-238	ENST00000514326	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SEC31A-238	ENST00000514326	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SEC31A-238	ENST00000514326	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SEC31A-238	ENST00000514326	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.6	■■■□□ 2.33
SEC31A-238	ENST00000514326	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.59	■■■□□ 2.33
SEC31A-238	ENST00000514326	WIZ	O95785	1651 aa		29.38	■■■□□ 2.29
SEC31A-238	ENST00000514326	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
SEC31A-238	ENST00000514326	NES	P48681	1621 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SEC31A-238	ENST00000514326	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SEC31A-238	ENST00000514326	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SEC31A-238	ENST00000514326	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SEC31A-238	ENST00000514326	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SEC31A-238	ENST00000514326	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SEC31A-238	ENST00000514326	CUX2	O14529	1486 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SEC31A-238	ENST00000514326	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SEC31A-238	ENST00000514326	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SEC31A-238	ENST00000514326	CFTR	P13569	1480 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SEC31A-238	ENST00000514326	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SEC31A-238	ENST00000514326	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.66	■■■□□ 2.18
SEC31A-238	ENST00000514326	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.64	■■■□□ 2.17
SEC31A-238	ENST00000514326	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SEC31A-238	ENST00000514326	WDR62	O43379	1518 aa		28.53	■■■□□ 2.16
SEC31A-238	ENST00000514326	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
SEC31A-238	ENST00000514326	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
SEC31A-238	ENST00000514326	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SEC31A-238	ENST00000514326	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SEC31A-238	ENST00000514326	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SEC31A-238	ENST00000514326	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SEC31A-238	ENST00000514326	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SEC31A-238	ENST00000514326	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SEC31A-238	ENST00000514326	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SEC31A-238	ENST00000514326	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SEC31A-238	ENST00000514326	CUX1	P39880	1505 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SEC31A-238	ENST00000514326	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SEC31A-238	ENST00000514326	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SEC31A-238	ENST00000514326	SOGA1	O94964	1423 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEC31A-238	ENST00000514326	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SEC31A-238	ENST00000514326	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04	9e-8	■■■□□ 15
SEC31A-238	ENST00000514326	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SEC31A-238	ENST00000514326	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SEC31A-238	ENST00000514326	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SEC31A-238	ENST00000514326	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.63	■■■□□ 2.01
SEC31A-238	ENST00000514326	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.57	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	FBLN2	P98095	1184 aa		27.56	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.55	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.54	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.52	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.52	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.52	■■■□□ 2
SEC31A-238	ENST00000514326	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SEC31A-238	ENST00000514326	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SEC31A-238	ENST00000514326	CHD1	O14646	1710 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SEC31A-238	ENST00000514326	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
SEC31A-238	ENST00000514326	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
SEC31A-238	ENST00000514326	TRIM41	Q8WV44	630 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SEC31A-238	ENST00000514326	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SEC31A-238	ENST00000514326	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.36	■■□□□ 1.97
SEC31A-238	ENST00000514326	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
SEC31A-238	ENST00000514326	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.34	■■□□□ 1.97
SEC31A-238	ENST00000514326	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.29	■■□□□ 1.96
SEC31A-238	ENST00000514326	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.29	■■□□□ 1.96
SEC31A-238	ENST00000514326	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.29	■■□□□ 1.96
SEC31A-238	ENST00000514326	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.27	■■□□□ 1.96
SEC31A-238	ENST00000514326	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.2	■■□□□ 1.94
SEC31A-238	ENST00000514326	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.18	■■□□□ 1.94
SEC31A-238	ENST00000514326	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.16	■■□□□ 1.94
SEC31A-238	ENST00000514326	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.16	■■□□□ 1.94
SEC31A-238	ENST00000514326	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.14	■■□□□ 1.94
SEC31A-238	ENST00000514326	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.12	■■□□□ 1.93
SEC31A-238	ENST00000514326	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.06	■■□□□ 1.92
SEC31A-238	ENST00000514326	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.06	■■□□□ 1.92
SEC31A-238	ENST00000514326	NUP160	Q12769	1436 aa		27.04	■■□□□ 1.92
SEC31A-238	ENST00000514326	IGF1R	P08069	1367 aa		27.03	■■□□□ 1.92
SEC31A-238	ENST00000514326	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.03	■■□□□ 1.92
SEC31A-238	ENST00000514326	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		26.87	■■□□□ 1.89
SEC31A-238	ENST00000514326	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		26.85	■■□□□ 1.89
SEC31A-238	ENST00000514326	CUL7	Q14999	1698 aa		26.85	■■□□□ 1.89
SEC31A-238	ENST00000514326	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		26.83	■■□□□ 1.89

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