Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 220.59■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 511.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 511.93□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 511.48□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-207ENST00000610559 542 ntTSL 411.35□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 511.18□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-211ENST00000615742 485 ntTSL 49.28□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 39.28□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX3X-205ENST00000480592 1001 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -14e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 316.22■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 512.94□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 510.57□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZBTB1-205ENST00000556818 453 ntTSL 420.54■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZBTB1-202ENST00000553583 582 ntTSL 317.1■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZBTB1-206ENST00000556965 509 ntTSL 43.38□□□□□ -1.875e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SRC-206ENST00000472968 461 ntTSL 318.74■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 C3-204ENST00000594936 625 ntTSL 216.61■□□□□ 0.258e-18■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.271e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)27.58■■■□□ 2.011e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.971e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.931e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 PRKD2-209ENST00000597589 1682 ntTSL 526.77■■□□□ 1.881e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 EIF5A-210ENST00000575001 609 ntTSL 226.6■■□□□ 1.851e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-211ENST00000538663 552 ntTSL 426.45■■□□□ 1.821e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.681e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.641e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.641e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.611e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 C8orf82-205ENST00000534680 1637 ntTSL 524.85■■□□□ 1.571e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 TMEM248-207ENST00000607045 690 ntTSL 324.82■■□□□ 1.561e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 PRKD2-212ENST00000599019 1703 ntTSL 524.43■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SEPT9-218ENST00000587514 540 ntTSL 524.22■■□□□ 1.474e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 223.5■■□□□ 1.351e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 IDUA-208ENST00000509948 796 ntTSL 322.78■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 422.5■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 IDUA-203ENST00000502910 714 ntTSL 322.39■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-209ENST00000536098 563 ntTSL 522.38■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SMUG1-223ENST00000634429 1093 ntTSL 522.35■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-210ENST00000530058 571 ntTSL 422.11■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF513-203ENST00000436006 510 ntTSL 221.88■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HOXC6-204ENST00000509328 358 ntTSL 321.85■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-210ENST00000537263 1318 ntTSL 321.74■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-204ENST00000535288 622 ntTSL 421.51■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-217ENST00000541898 1198 ntTSL 221.51■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 IDUA-209ENST00000514192 697 ntTSL 321.36■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 IDUA-204ENST00000504568 586 ntTSL 321.27■■□□□ 11e-6■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 220.56■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-208ENST00000425451 621 ntTSL 520.14■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-204ENST00000417107 569 ntTSL 420.08■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-212ENST00000434070 645 ntTSL 420.08■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-213ENST00000440293 580 ntTSL 420.07■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-212ENST00000530655 786 ntTSL 319.83■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 DDX56-207ENST00000448192 691 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-205ENST00000417902 576 ntTSL 319.62■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-219ENST00000545091 1079 ntTSL 519.5■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-214ENST00000540707 557 ntTSL 419.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ARMC6-218ENST00000543877 537 ntTSL 419.44■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 219.43■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AC008443.5-201ENST00000514487 289 ntTSL 319.04■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SCLY-209ENST00000437134 760 ntTSL 518.61■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 HDAC7-210ENST00000430670 914 ntTSL 518.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-209ENST00000528683 721 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SCLY-203ENST00000412508 585 ntTSL 218.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 SCLY-213ENST00000450965 1918 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 RNF121-204ENST00000490867 840 ntTSL 518.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 30.9
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