RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537263.5

ARMC6-210, Transcript of armadillo repeat containing 6, humanhuman

TSL 3

Gene ARMC6, Length 1,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC6-210ENST00000537263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.06■■■■■ 5.28
ARMC6-210ENST00000537263 ABCC9O60706 1549 aa43.56■■■■■ 4.56
ARMC6-210ENST00000537263 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.44■■■■■ 4.54
ARMC6-210ENST00000537263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.46■■■■■ 4.23
ARMC6-210ENST00000537263 NACADO15069 1562 aa41.08■■■■■ 4.17
ARMC6-210ENST00000537263 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.04■■■■■ 4.16
ARMC6-210ENST00000537263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.52■■■■■ 4.08
ARMC6-210ENST00000537263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.51■■■■■ 4.08
ARMC6-210ENST00000537263 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.45■■■■■ 4.07
ARMC6-210ENST00000537263 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
ARMC6-210ENST00000537263 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.18■■■■■ 4.02
ARMC6-210ENST00000537263 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
ARMC6-210ENST00000537263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.78■■■■□ 3.96
ARMC6-210ENST00000537263 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.78■■■■□ 3.96
ARMC6-210ENST00000537263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.41■■■■□ 3.9
ARMC6-210ENST00000537263 SCRIBQ14160 1630 aa39.4■■■■□ 3.9
ARMC6-210ENST00000537263 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.33■■■■□ 3.89
ARMC6-210ENST00000537263 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ARMC6-210ENST00000537263 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.07■■■■□ 3.68
ARMC6-210ENST00000537263 NCAPD3P42695 1498 aa37.87■■■■□ 3.65
ARMC6-210ENST00000537263 CUX2O14529 1486 aa37.83■■■■□ 3.65
ARMC6-210ENST00000537263 ERCC6Q03468 1493 aa37.7■■■■□ 3.63
ARMC6-210ENST00000537263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.67■■■■□ 3.62
ARMC6-210ENST00000537263 SMARCA2P51531 1590 aa37.65■■■■□ 3.62
ARMC6-210ENST00000537263 HMGXB3Q12766 1538 aa37.64■■■■□ 3.62
ARMC6-210ENST00000537263 SMARCA4P51532 1647 aa37.61■■■■□ 3.61
ARMC6-210ENST00000537263 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
ARMC6-210ENST00000537263 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
ARMC6-210ENST00000537263 NESP48681 1621 aa37.3■■■■□ 3.56
ARMC6-210ENST00000537263 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.29■■■■□ 3.56
ARMC6-210ENST00000537263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.14■■■■□ 3.54
ARMC6-210ENST00000537263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
ARMC6-210ENST00000537263 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.97■■■■□ 3.51
ARMC6-210ENST00000537263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.92■■■■□ 3.5
ARMC6-210ENST00000537263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.89■■■■□ 3.5
ARMC6-210ENST00000537263 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.67■■■■□ 3.46
ARMC6-210ENST00000537263 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.59■■■■□ 3.45
ARMC6-210ENST00000537263 WDR62O43379 1518 aa36.54■■■■□ 3.44
ARMC6-210ENST00000537263 WIZO95785 1651 aa36.54■■■■□ 3.44
ARMC6-210ENST00000537263 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.38■■■■□ 3.41
ARMC6-210ENST00000537263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.27■■■■□ 3.4
ARMC6-210ENST00000537263 CFTRP13569 1480 aa36.21■■■■□ 3.39
ARMC6-210ENST00000537263 TRIM41Q8WV44 630 aa36.18■■■■□ 3.38
ARMC6-210ENST00000537263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-210ENST00000537263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
ARMC6-210ENST00000537263 PRDM2Q13029 1718 aa35.97■■■■□ 3.35
ARMC6-210ENST00000537263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
ARMC6-210ENST00000537263 OSCARQ8IYS5 282 aa35.92■■■■□ 3.34
ARMC6-210ENST00000537263 IFT140Q96RY7 1462 aa35.67■■■■□ 3.3
ARMC6-210ENST00000537263 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.62■■■■□ 3.29
ARMC6-210ENST00000537263 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.56■■■■□ 3.28
ARMC6-210ENST00000537263 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.56■■■■□ 3.28
ARMC6-210ENST00000537263 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.56■■■■□ 3.28
ARMC6-210ENST00000537263 TOPBP1Q92547 1522 aa35.55■■■■□ 3.28
ARMC6-210ENST00000537263 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
ARMC6-210ENST00000537263 ABCC8Q09428 1581 aa35.53■■■■□ 3.28
ARMC6-210ENST00000537263 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ARMC6-210ENST00000537263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.44■■■■□ 3.26
ARMC6-210ENST00000537263 ARHGEF11O15085 1522 aa35.41■■■■□ 3.26
ARMC6-210ENST00000537263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
ARMC6-210ENST00000537263 CHD1O14646 1710 aa35.26■■■■□ 3.23
ARMC6-210ENST00000537263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.17■■■■□ 3.224e-6■■■■□ 23.2
ARMC6-210ENST00000537263 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
ARMC6-210ENST00000537263 WDR97A6NE52 1622 aa35.04■■■■□ 3.2
ARMC6-210ENST00000537263 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.04■■■■□ 3.2
ARMC6-210ENST00000537263 ARAP1Q96P48 1450 aa35■■■■□ 3.19
ARMC6-210ENST00000537263 FBLN2P98095 1184 aa34.97■■■■□ 3.19
ARMC6-210ENST00000537263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.96■■■■□ 3.19
ARMC6-210ENST00000537263 SOGA1O94964 1423 aa34.96■■■■□ 3.19
ARMC6-210ENST00000537263 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
ARMC6-210ENST00000537263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.88■■■■□ 3.17
ARMC6-210ENST00000537263 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.86■■■■□ 3.17
ARMC6-210ENST00000537263 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.84■■■■□ 3.17
ARMC6-210ENST00000537263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
ARMC6-210ENST00000537263 SYNJ1O43426 1573 aa34.81■■■■□ 3.16
ARMC6-210ENST00000537263 CUX1P39880 1505 aa34.78■■■■□ 3.16
ARMC6-210ENST00000537263 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
ARMC6-210ENST00000537263 GRIN2BQ13224 1484 aa34.75■■■■□ 3.15
ARMC6-210ENST00000537263 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
ARMC6-210ENST00000537263 SYNJ2O15056 1496 aa34.69■■■■□ 3.14
ARMC6-210ENST00000537263 PBRM1Q86U86 1689 aa34.65■■■■□ 3.14
ARMC6-210ENST00000537263 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.56■■■■□ 3.12
ARMC6-210ENST00000537263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.52■■■■□ 3.12
ARMC6-210ENST00000537263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.51■■■■□ 3.11
ARMC6-210ENST00000537263 GRIN2AQ12879 1464 aa34.3■■■■□ 3.08
ARMC6-210ENST00000537263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
ARMC6-210ENST00000537263 ADAMTS12P58397 1594 aa34.27■■■■□ 3.08
ARMC6-210ENST00000537263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
ARMC6-210ENST00000537263 NUP160Q12769 1436 aa34.21■■■■□ 3.07
ARMC6-210ENST00000537263 TOP2BQ02880 1626 aa34.2■■■■□ 3.07
ARMC6-210ENST00000537263 CEP170Q5SW79 1584 aa34.19■■■■□ 3.06
ARMC6-210ENST00000537263 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.16■■■■□ 3.06
ARMC6-210ENST00000537263 SHROOM2Q13796 1616 aa34.15■■■■□ 3.06
ARMC6-210ENST00000537263 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.13■■■■□ 3.05
ARMC6-210ENST00000537263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.1■■■■□ 3.05
ARMC6-210ENST00000537263 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ARMC6-210ENST00000537263 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
ARMC6-210ENST00000537263 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.88■■■■□ 3.01
ARMC6-210ENST00000537263 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
ARMC6-210ENST00000537263 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms