Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUFIP1Q9UHK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUFIP1Q9UHK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUFIP1Q9UHK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUFIP1Q9UHK0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUFIP1Q9UHK0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUFIP1Q9UHK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms