Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL42Q9P2K6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL42Q9P2K6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL42Q9P2K6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL42Q9P2K6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL42Q9P2K6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL42Q9P2K6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL42Q9P2K6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms