Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCLK3Q9C098 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCLK3Q9C098 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCLK3Q9C098 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCLK3Q9C098 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCLK3Q9C098 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DCLK3Q9C098 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DCLK3Q9C098 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCLK3Q9C098 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms