Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC25A23Q9BV35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC25A23Q9BV35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC25A23Q9BV35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC25A23Q9BV35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC25A23Q9BV35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC25A23Q9BV35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A23Q9BV35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms