Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC25A23Q9BV35 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC25A23Q9BV35 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC25A23Q9BV35 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC25A23Q9BV35 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC25A23Q9BV35 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC25A23Q9BV35 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLC25A23Q9BV35 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SLC25A23Q9BV35 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC25A23Q9BV35 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SLC25A23Q9BV35 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC25A23Q9BV35 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC25A23Q9BV35 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC25A23Q9BV35 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLC25A23Q9BV35 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLC25A23Q9BV35 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLC25A23Q9BV35 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC25A23Q9BV35 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SLC25A23Q9BV35 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC25A23Q9BV35 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC25A23Q9BV35 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLC25A23Q9BV35 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC25A23Q9BV35 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC25A23Q9BV35 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC25A23Q9BV35 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC25A23Q9BV35 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC25A23Q9BV35 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC25A23Q9BV35 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC25A23Q9BV35 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC25A23Q9BV35 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC25A23Q9BV35 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC25A23Q9BV35 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC25A23Q9BV35 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC25A23Q9BV35 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC25A23Q9BV35 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC25A23Q9BV35 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC25A23Q9BV35 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC25A23Q9BV35 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SLC25A23Q9BV35 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC25A23Q9BV35 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC25A23Q9BV35 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC25A23Q9BV35 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC25A23Q9BV35 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC25A23Q9BV35 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC25A23Q9BV35 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC25A23Q9BV35 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC25A23Q9BV35 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC25A23Q9BV35 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC25A23Q9BV35 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC25A23Q9BV35 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SLC25A23Q9BV35 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC25A23Q9BV35 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC25A23Q9BV35 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC25A23Q9BV35 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC25A23Q9BV35 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC25A23Q9BV35 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC25A23Q9BV35 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC25A23Q9BV35 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC25A23Q9BV35 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC25A23Q9BV35 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC25A23Q9BV35 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC25A23Q9BV35 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC25A23Q9BV35 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC25A23Q9BV35 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC25A23Q9BV35 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC25A23Q9BV35 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC25A23Q9BV35 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC25A23Q9BV35 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC25A23Q9BV35 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC25A23Q9BV35 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC25A23Q9BV35 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC25A23Q9BV35 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC25A23Q9BV35 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC25A23Q9BV35 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC25A23Q9BV35 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC25A23Q9BV35 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC25A23Q9BV35 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC25A23Q9BV35 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC25A23Q9BV35 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC25A23Q9BV35 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC25A23Q9BV35 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC25A23Q9BV35 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC25A23Q9BV35 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC25A23Q9BV35 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC25A23Q9BV35 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC25A23Q9BV35 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC25A23Q9BV35 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC25A23Q9BV35 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC25A23Q9BV35 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC25A23Q9BV35 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC25A23Q9BV35 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC25A23Q9BV35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC25A23Q9BV35 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC25A23Q9BV35 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC25A23Q9BV35 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC25A23Q9BV35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC25A23Q9BV35 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC25A23Q9BV35 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC25A23Q9BV35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC25A23Q9BV35 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms