Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZFP3Q96NJ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP3Q96NJ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP3Q96NJ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP3Q96NJ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFP3Q96NJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFP3Q96NJ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms