Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRN2Q92932 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRN2Q92932 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRN2Q92932 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRN2Q92932 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRN2Q92932 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRN2Q92932 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRN2Q92932 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms