Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHCHD4Q8N4Q1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHCHD4Q8N4Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHCHD4Q8N4Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD4Q8N4Q1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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