Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYS1

PM20D2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PM20D2Q8IYS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms