Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTAR1Q7Z6K3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTAR1Q7Z6K3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTAR1Q7Z6K3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTAR1Q7Z6K3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTAR1Q7Z6K3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTAR1Q7Z6K3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTAR1Q7Z6K3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms