Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX9Q7RTT3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX9Q7RTT3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX9Q7RTT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX9Q7RTT3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX9Q7RTT3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX9Q7RTT3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms