Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN84

CCDC81, Coiled-coil domain-containing protein 81, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC81Q6ZN84 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC81Q6ZN84 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC81Q6ZN84 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC81Q6ZN84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC81Q6ZN84 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC81Q6ZN84 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC81Q6ZN84 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC81Q6ZN84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms