Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UFSP1Q6NVU6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UFSP1Q6NVU6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UFSP1Q6NVU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UFSP1Q6NVU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms