Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMC4Q5J8M3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMC4Q5J8M3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMC4Q5J8M3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EMC4Q5J8M3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EMC4Q5J8M3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EMC4Q5J8M3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMC4Q5J8M3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms