Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 320.7■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 53
NOLC1Q14978 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 320.38■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 53
NOLC1Q14978 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-25■■■■■ 53
NOLC1Q14978 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.89□□□□□ -1.312e-25■■■■■ 53
NOLC1Q14978 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-10■■■■■ 52.1
NOLC1Q14978 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 29.01□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 52.1
NOLC1Q14978 SNHG1-216ENST00000541416 996 ntTSL 213.37□□□□□ -0.274e-19■■■■■ 52.1
NOLC1Q14978 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.033e-18■■■■■ 51.9
NOLC1Q14978 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.22□□□□□ -0.453e-18■■■■■ 51.9
NOLC1Q14978 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.06□□□□□ -0.483e-18■■■■■ 51.9
NOLC1Q14978 NOP56-208ENST00000467857 735 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-323■■■■■ 51.8
NOLC1Q14978 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.361e-323■■■■■ 51.8
NOLC1Q14978 GNL3-205ENST00000468146 533 ntTSL 411.28□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 51.3
NOLC1Q14978 GNL3-210ENST00000492349 729 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-9■■■■■ 51.3
NOLC1Q14978 GNL3-208ENST00000479230 547 ntTSL 47.75□□□□□ -1.171e-9■■■■■ 51.3
NOLC1Q14978 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.861e-9■■■■■ 51.3
NOLC1Q14978 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.571e-9■■■■■ 51.3
NOLC1Q14978 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.58□□□□□ -21e-31■■■■■ 51.1
NOLC1Q14978 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.13e-9■■■■■ 51
NOLC1Q14978 CEP97-204ENST00000467655 1782 ntTSL 27.14□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 51
NOLC1Q14978 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 51
NOLC1Q14978 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-9■■■■■ 50.7
NOLC1Q14978 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 50.7
NOLC1Q14978 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.461e-9■■■■■ 50.7
NOLC1Q14978 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 50.7
NOLC1Q14978 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 29.62□□□□□ -0.871e-9■■■■■ 50.7
NOLC1Q14978 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.45□□□□□ -1.061e-9■■■■■ 50.7
NOLC1Q14978 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 515.68■□□□□ 0.11e-9■■■■■ 49.9
NOLC1Q14978 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 214.91□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 49.9
NOLC1Q14978 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 311.73□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 49.9
NOLC1Q14978 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 58.34□□□□□ -1.073e-31■■■■■ 49.6
NOLC1Q14978 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.183e-31■■■■■ 49.6
NOLC1Q14978 UQCRH-202ENST00000460947 621 ntTSL 29.56□□□□□ -0.884e-14■■■■■ 49.4
NOLC1Q14978 EIF4A2-218ENST00000475653 909 ntTSL 26.66□□□□□ -1.344e-110■■■■■ 49.1
NOLC1Q14978 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.531e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt15.95■□□□□ 0.141e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.091e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 511.42□□□□□ -0.581e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 210.55□□□□□ -0.721e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 59.35□□□□□ -0.911e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 28.1□□□□□ -1.111e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-323■■■■■ 48.7
NOLC1Q14978 RPL3-207ENST00000459859 447 ntTSL 321.85■■□□□ 1.091e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPL3-218ENST00000498462 669 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPL3-208ENST00000460589 630 ntTSL 218.58■□□□□ 0.561e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPL3-205ENST00000427905 782 ntTSL 515.51■□□□□ 0.071e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPL3-209ENST00000461967 767 ntTSL 214.33□□□□□ -0.121e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPL3-217ENST00000484615 827 ntTSL 214.2□□□□□ -0.141e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPL3-204ENST00000420536 711 ntTSL 510.06□□□□□ -0.81e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.071e-323■■■■■ 48.5
NOLC1Q14978 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.675e-14■■■■■ 47.6
NOLC1Q14978 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 24.27□□□□□ -1.735e-14■■■■■ 47.6
NOLC1Q14978 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.973e-20■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.285e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-202ENST00000424478 3174 ntTSL 214.66□□□□□ -0.065e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-203ENST00000477626 3507 ntTSL 213.44□□□□□ -0.265e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.76□□□□□ -1.815e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-207ENST00000554439 2982 ntTSL 53.07□□□□□ -1.925e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-206ENST00000554429 2977 ntTSL 52.8□□□□□ -1.965e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-205ENST00000554081 3223 ntTSL 52.71□□□□□ -1.985e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 PRPF39-208ENST00000554785 2121 ntTSL 22.15□□□□□ -2.075e-32■■■■■ 47.5
NOLC1Q14978 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 46.6
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NOLC1Q14978 MXD4-205ENST00000515378 522 ntTSL 215.81■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 46.6
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NOLC1Q14978 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 25.13□□□□□ -1.591e-323■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.613e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.043e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.173e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.223e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 57.24□□□□□ -1.253e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 56.58□□□□□ -1.363e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-110■■■■■ 46.6
NOLC1Q14978 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.689e-68■■■■■ 46.1
NOLC1Q14978 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-15■■■■■ 45.9
NOLC1Q14978 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.281e-15■■■■■ 45.9
NOLC1Q14978 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7□□□□□ -1.291e-323■■■■■ 45.8
NOLC1Q14978 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.891e-323■■■■■ 45.6
NOLC1Q14978 SNHG10-203ENST00000554169 981 ntTSL 215.23■□□□□ 0.031e-323■■■■■ 45.6
NOLC1Q14978 SNHG10-204ENST00000555866 221 ntTSL 214.9□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 45.6
NOLC1Q14978 SNHG10-202ENST00000553559 428 ntTSL 314.56□□□□□ -0.081e-323■■■■■ 45.6
NOLC1Q14978 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.24□□□□□ -1.731e-323■■■■■ 45.6
NOLC1Q14978 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.78□□□□□ -1.481e-323■■■■■ 45.6
NOLC1Q14978 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-14■■■■■ 45.5
NOLC1Q14978 UQCRH-205ENST00000496387 674 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.384e-14■■■■■ 45.5
NOLC1Q14978 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 24.98□□□□□ -1.614e-14■■■■■ 45.5
NOLC1Q14978 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 44.6
NOLC1Q14978 PZP-203ENST00000539983 1504 ntTSL 211.5□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 PZP-207ENST00000546197 1048 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.875e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 PZP-205ENST00000543108 580 ntTSL 49.48□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 PZP-204ENST00000540995 483 ntTSL 38.99□□□□□ -0.975e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 PZP-202ENST00000535230 4417 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.65□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 GNG7-202ENST00000587867 723 ntTSL 510.3□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 44.2
NOLC1Q14978 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)24.35■■□□□ 1.492e-18■■■■■ 43.9
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