Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A4Q13733 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A4Q13733 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A4Q13733 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A4Q13733 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A4Q13733 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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