Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSG9Q00887 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSG9Q00887 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSG9Q00887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG9Q00887 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSG9Q00887 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSG9Q00887 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms