Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PER3P56645 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PER3P56645 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PER3P56645 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PER3P56645 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PER3P56645 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PER3P56645 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PER3P56645 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PER3P56645 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PER3P56645 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PER3P56645 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PER3P56645 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PER3P56645 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PER3P56645 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PER3P56645 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PER3P56645 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PER3P56645 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PER3P56645 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PER3P56645 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PER3P56645 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PER3P56645 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PER3P56645 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PER3P56645 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PER3P56645 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PER3P56645 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PER3P56645 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PER3P56645 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PER3P56645 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PER3P56645 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PER3P56645 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PER3P56645 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PER3P56645 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PER3P56645 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PER3P56645 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PER3P56645 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PER3P56645 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PER3P56645 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PER3P56645 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PER3P56645 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PER3P56645 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PER3P56645 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PER3P56645 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PER3P56645 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PER3P56645 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PER3P56645 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PER3P56645 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PER3P56645 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PER3P56645 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PER3P56645 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PER3P56645 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PER3P56645 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PER3P56645 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PER3P56645 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PER3P56645 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PER3P56645 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PER3P56645 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PER3P56645 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PER3P56645 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PER3P56645 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PER3P56645 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PER3P56645 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PER3P56645 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PER3P56645 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PER3P56645 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PER3P56645 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PER3P56645 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER3P56645 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER3P56645 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER3P56645 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER3P56645 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER3P56645 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER3P56645 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER3P56645 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER3P56645 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER3P56645 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER3P56645 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PER3P56645 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER3P56645 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PER3P56645 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PER3P56645 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PER3P56645 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PER3P56645 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PER3P56645 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PER3P56645 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PER3P56645 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PER3P56645 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PER3P56645 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PER3P56645 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PER3P56645 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PER3P56645 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PER3P56645 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PER3P56645 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PER3P56645 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PER3P56645 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PER3P56645 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PER3P56645 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PER3P56645 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PER3P56645 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PER3P56645 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PER3P56645 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms