Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PER3P56645 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PER3P56645 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PER3P56645 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PER3P56645 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PER3P56645 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PER3P56645 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PER3P56645 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PER3P56645 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PER3P56645 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PER3P56645 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PER3P56645 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PER3P56645 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PER3P56645 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PER3P56645 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PER3P56645 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PER3P56645 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PER3P56645 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PER3P56645 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PER3P56645 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PER3P56645 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PER3P56645 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PER3P56645 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PER3P56645 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PER3P56645 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PER3P56645 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PER3P56645 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PER3P56645 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PER3P56645 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PER3P56645 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PER3P56645 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PER3P56645 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PER3P56645 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PER3P56645 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PER3P56645 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PER3P56645 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PER3P56645 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PER3P56645 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER3P56645 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PER3P56645 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PER3P56645 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PER3P56645 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PER3P56645 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PER3P56645 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PER3P56645 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PER3P56645 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PER3P56645 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER3P56645 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PER3P56645 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PER3P56645 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PER3P56645 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PER3P56645 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PER3P56645 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PER3P56645 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PER3P56645 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PER3P56645 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PER3P56645 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PER3P56645 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PER3P56645 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PER3P56645 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PER3P56645 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PER3P56645 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PER3P56645 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PER3P56645 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PER3P56645 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PER3P56645 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PER3P56645 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PER3P56645 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PER3P56645 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PER3P56645 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PER3P56645 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER3P56645 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER3P56645 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PER3P56645 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PER3P56645 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PER3P56645 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PER3P56645 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PER3P56645 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PER3P56645 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER3P56645 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PER3P56645 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PER3P56645 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PER3P56645 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PER3P56645 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PER3P56645 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER3P56645 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PER3P56645 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PER3P56645 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PER3P56645 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PER3P56645 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PER3P56645 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PER3P56645 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PER3P56645 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PER3P56645 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PER3P56645 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PER3P56645 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PER3P56645 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PER3P56645 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PER3P56645 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PER3P56645 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms